More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0398 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  82.54 
 
 		 131 aa  224  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  84 
 
 		 127 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  82.79 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  59.84 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  46.79 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  44.95 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0541  hypothetical protein  45.37 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0982669  normal  0.227881 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2201  protein of unknown function DUF59  44.66 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0615037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.24 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  48.86 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  45.63 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  44.14 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  45.56 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  48.89 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  46.15 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  41.51 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  46.15 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  43.56 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40.91 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  46.59 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  40.57 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  43.01 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2619  protein of unknown function DUF59  41.12 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.830431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  43.96 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  47.78 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  45.05 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  41.23 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  41.23 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  41.58 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  43.1 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  41.49 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  44.83 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  44.79 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40.78 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  39.22 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  39.64 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  43.33 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  41.11 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  37.7 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  46.07 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.55 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  44.94 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  39.62 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  44.58 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  38.68 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  34.41 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  43.82 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.56 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.53 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  39.18 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  37.14 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  38.64 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  42.39 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  42.39 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  41.49 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  27.84 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  39.29 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  37.63 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  36.56 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  37.89 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  35.45 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  39.13 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  38.95 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  41.25 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  42.39 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  32.67 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  37.93 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  33.65 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  36.08 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  41.11 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  32.35 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  30.61 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  37.21 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.37 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  40.38 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>