139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4256 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4256  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  37.38 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0541  hypothetical protein  32.29 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0982669  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  35.48 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4255  hypothetical protein  36.08 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  37.18 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2211  serine O-acetyltransferase  29.36 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  36.63 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  28.89 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  32.99 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  31.18 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  31.52 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  32.74 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  36.26 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  30.53 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  31.18 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  37.18 
 
 		 323 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  31.91 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0398  hypothetical protein  26.21 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  27.37 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  28.26 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  27.84 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  34.62 
 
 		 320 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  26.6 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  40.35 
 
 		 366 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  31.52 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  27.18 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  35.29 
 
 		 356 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  29.2 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  28.41 
 
 		 365 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  33.04 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  27.47 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  34.69 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  30 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2201  protein of unknown function DUF59  27.85 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0615037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  29.17 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  27.27 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  25.81 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  38.1 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  32.38 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  29.87 
 
 		 368 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  31.19 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  32.38 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  30.11 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  33.82 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  29.36 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  30.61 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  31.3 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  31.3 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  31.3 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  30.7 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  33.68 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  30.77 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  32.38 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  28.16 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  44.44 
 
 		 438 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  30.7 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2619  protein of unknown function DUF59  27.55 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.830431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.7 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  29 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  32.2 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0809  hypothetical protein  34.67 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  30.11 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  28.97 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  27.08 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  22.68 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  32.2 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  31.03 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  37.93 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  33.85 
 
 		 395 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1117  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  28.72 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00882242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  31.18 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.67 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  27.52 
 
 		 139 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  26.72 
 
 		 131 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  29.03 
 
 		 110 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  27.52 
 
 		 139 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  41.18 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  38.33 
 
 		 361 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  36.17 
 
 		 349 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>