More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2226 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 365 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  63.01 
 
 		 367 aa  475  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  58.97 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  60.44 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  59.39 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  53.78 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.27 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  54.85 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.28 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  53.46 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  54.12 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  49.86 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  49.31 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  49.31 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.03 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  51.4 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  54.17 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  50.29 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  50.76 
 
 		 361 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  51.27 
 
 		 367 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  53.11 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  48.93 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  49.23 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  48.44 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  47.6 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  50.29 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  50.61 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  50.46 
 
 		 356 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  48.6 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  48.14 
 
 		 349 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  46.86 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  51.74 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  51.74 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.99 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  51.16 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  46.22 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  47.43 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  47.89 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.48 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  47.16 
 
 		 363 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.76 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.94 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.98 
 
 		 305 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  46.65 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.81 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  47.84 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  48.18 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  44.54 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.88 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  47.86 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  46.06 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  47.2 
 
 		 345 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.13 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  46.59 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  46.59 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  43.97 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  41.01 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  44.16 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.45 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.19 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  43.92 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  45.17 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  39.83 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  48.29 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  44.19 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  47.32 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.94 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  44.89 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  46.88 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  48.62 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  46.48 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  48.78 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  46.77 
 
 		 371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  43.33 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.21 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  49.4 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  46.07 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  43.58 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.94 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  45.28 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  43.49 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.85 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  45.94 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.74 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.66 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.66 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  43.19 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.17 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  40.11 
 
 		 355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  47.71 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  44.51 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  44.51 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.56 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.17 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  47.84 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  45.29 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  40.17 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  45.61 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>