More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2174 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  702    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  77.65 
 
 
349 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1569  hypothetical protein  56.43 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118472  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  50 
 
 
359 aa  348  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  49.72 
 
 
363 aa  338  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  54.07 
 
 
361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  54.07 
 
 
361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  53.78 
 
 
361 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  49.57 
 
 
360 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  51.16 
 
 
371 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  48.86 
 
 
357 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  48.18 
 
 
365 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.19 
 
 
395 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  46.57 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.55 
 
 
353 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.55 
 
 
353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  46.94 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  50.58 
 
 
361 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  45.94 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  47.51 
 
 
370 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  48.58 
 
 
364 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  45.94 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  44.89 
 
 
353 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  47.29 
 
 
367 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  44.6 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  47.99 
 
 
356 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  47.18 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  47.99 
 
 
356 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  46.78 
 
 
366 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46 
 
 
367 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  43.87 
 
 
368 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  47.52 
 
 
356 aa  293  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.83 
 
 
358 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  44.76 
 
 
368 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.83 
 
 
358 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  45.27 
 
 
363 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.85 
 
 
365 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.06 
 
 
363 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  40.69 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.8 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.13 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.11 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  41.83 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.48 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  43.27 
 
 
361 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  46.55 
 
 
362 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  55.34 
 
 
305 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  44 
 
 
365 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.21 
 
 
348 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  44.77 
 
 
358 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  41.24 
 
 
388 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.48 
 
 
363 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  53.97 
 
 
373 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.51 
 
 
387 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  41.73 
 
 
386 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  43.92 
 
 
375 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  42.25 
 
 
394 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.3 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  53.97 
 
 
378 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  40.6 
 
 
382 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  42.52 
 
 
347 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  42.25 
 
 
362 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  53.15 
 
 
374 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  44.93 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  44.93 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  40.6 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.57 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  42.69 
 
 
364 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.32 
 
 
362 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  43.9 
 
 
368 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  42.9 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  41.67 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  42.41 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.86 
 
 
362 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  42.2 
 
 
364 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  40.34 
 
 
376 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  43.94 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.48 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  42.12 
 
 
364 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.27 
 
 
345 aa  269  7e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  44.74 
 
 
362 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.69 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  41.44 
 
 
389 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  52.51 
 
 
382 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  42.41 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  42.69 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  42.2 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  44.41 
 
 
363 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  52.19 
 
 
374 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  42.98 
 
 
362 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  45.64 
 
 
376 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.3 
 
 
374 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.18 
 
 
362 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  52.19 
 
 
394 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  42.7 
 
 
364 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  39.94 
 
 
356 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  40.06 
 
 
373 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.53 
 
 
372 aa  262  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>