More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1590 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
347 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  44.83 
 
 
356 aa  321  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.16 
 
 
353 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  44.73 
 
 
353 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.87 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  43.06 
 
 
361 aa  305  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  46.13 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  46.02 
 
 
371 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  44.25 
 
 
367 aa  299  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.1 
 
 
367 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  45.8 
 
 
356 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.7 
 
 
359 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.73 
 
 
395 aa  292  7e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  44.94 
 
 
356 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  44.15 
 
 
360 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.19 
 
 
363 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.9 
 
 
363 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.57 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  43.6 
 
 
364 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  39.66 
 
 
390 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
368 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  43.92 
 
 
365 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  37.85 
 
 
394 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  41.89 
 
 
363 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  40.73 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  41.98 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  37.57 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  39.11 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  43.24 
 
 
349 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  43.68 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  42.18 
 
 
351 aa  272  5.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  39.77 
 
 
364 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  37.71 
 
 
384 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  43.39 
 
 
361 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  43.39 
 
 
361 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  41.98 
 
 
358 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  42.07 
 
 
345 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  37.09 
 
 
389 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  42.4 
 
 
336 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  40.06 
 
 
356 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  46.2 
 
 
368 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  39.13 
 
 
357 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  40.23 
 
 
361 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  40.36 
 
 
370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  40.75 
 
 
363 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.9 
 
 
362 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  39.15 
 
 
357 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.95 
 
 
348 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.9 
 
 
362 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  35.57 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  41.62 
 
 
361 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  41.26 
 
 
363 aa  262  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  40.29 
 
 
357 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  42 
 
 
361 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  38.87 
 
 
364 aa  260  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  39.77 
 
 
356 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.42 
 
 
305 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.37 
 
 
362 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.19 
 
 
376 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  39.55 
 
 
377 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  37.35 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  39.88 
 
 
388 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  41.21 
 
 
368 aa  258  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  40.17 
 
 
357 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  39.13 
 
 
354 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  40.84 
 
 
363 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  37.32 
 
 
364 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  39.88 
 
 
358 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  39.88 
 
 
358 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.48 
 
 
367 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  42.61 
 
 
368 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  39.88 
 
 
364 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  37.03 
 
 
364 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  41.04 
 
 
363 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  38.2 
 
 
380 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  38 
 
 
367 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  38 
 
 
361 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
298 aa  255  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  40.95 
 
 
369 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  38.76 
 
 
355 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  40.12 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  36.87 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  38.11 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  38.55 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  37.75 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  38.4 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  40.96 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  39.6 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  41.36 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  39.19 
 
 
367 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  49.14 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  40.46 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  41.76 
 
 
362 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  39.59 
 
 
364 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  39.2 
 
 
356 aa  253  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  37.53 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.54 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  40.17 
 
 
362 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>