More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0549 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  94.92 
 
 
394 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
388 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  77.24 
 
 
384 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  73.33 
 
 
387 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  73.08 
 
 
394 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  73.08 
 
 
389 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  75.98 
 
 
386 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  69.33 
 
 
379 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  59.47 
 
 
376 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  60.96 
 
 
370 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  58.47 
 
 
394 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  56.33 
 
 
375 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  58.6 
 
 
373 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  56.51 
 
 
364 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  54.78 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  57.45 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  56.59 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  54.22 
 
 
364 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  55.58 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  58.49 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  54.78 
 
 
382 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  58.22 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  55.64 
 
 
374 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  52.94 
 
 
382 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  55.64 
 
 
374 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  55.24 
 
 
415 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  51.46 
 
 
382 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  48.5 
 
 
357 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.29 
 
 
363 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  53.66 
 
 
360 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  49.46 
 
 
368 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  48.54 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  48.54 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  51.14 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  46.31 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.8 
 
 
363 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  45.41 
 
 
354 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  47.31 
 
 
362 aa  322  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  45.33 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.55 
 
 
362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.22 
 
 
363 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  47.14 
 
 
359 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.62 
 
 
362 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.1 
 
 
362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  49.73 
 
 
362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.19 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  46.55 
 
 
363 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  45.97 
 
 
362 aa  309  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  45.62 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  54.88 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.81 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  58.09 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.92 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  43.8 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.04 
 
 
364 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44.95 
 
 
364 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.3 
 
 
353 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.77 
 
 
363 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.3 
 
 
353 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  57.68 
 
 
362 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  57.68 
 
 
362 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  44.41 
 
 
363 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  45.07 
 
 
353 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  46.05 
 
 
363 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.57 
 
 
362 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  43.95 
 
 
361 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  45.41 
 
 
355 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  56.57 
 
 
362 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  44.79 
 
 
356 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  46.15 
 
 
363 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
363 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  57.77 
 
 
361 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.39 
 
 
363 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  42.82 
 
 
369 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  42.18 
 
 
360 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.06 
 
 
371 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  42.3 
 
 
370 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  42.3 
 
 
370 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  43.35 
 
 
356 aa  289  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  42.3 
 
 
370 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.15 
 
 
363 aa  289  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.18 
 
 
348 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  58.13 
 
 
362 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.13 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 
363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  42.27 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 
363 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  54.98 
 
 
374 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  43.58 
 
 
369 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  42.29 
 
 
357 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  45.73 
 
 
356 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  44.41 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.73 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.73 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  44.41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>