More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4565 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  92.59 
 
 		 373 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  100 
 
 		 378 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  98.15 
 
 		 375 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  78.01 
 
 		 382 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  75.85 
 
 		 374 aa  547  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  73.75 
 
 		 374 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  61.33 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  56.81 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  60.53 
 
 		 376 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  55.56 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  60.53 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  55.33 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  56.96 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  55.61 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  55.08 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  55.59 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  57.45 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  56.96 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  57.26 
 
 		 379 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  57.41 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  57.98 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  55.81 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  57.41 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  54.23 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  53.56 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  49.58 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  50.41 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  55.49 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  51.6 
 
 		 382 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  52.25 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  50.82 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  48.61 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.35 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  51.82 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  47.35 
 
 		 362 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.57 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  62.14 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  62.14 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  44.85 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  52.37 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.52 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  45.68 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  46.32 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  54.58 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  44.18 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  50.65 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  61.38 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  50.14 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  46.05 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  44.3 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.23 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.46 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  44.74 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  44.74 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  45.91 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  56.57 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.44 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  49.17 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  44.51 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.9 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  44.01 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  56.18 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 		 362 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  56.97 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  49.3 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  47.19 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  45.22 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  45.22 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.03 
 
 		 359 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  54.72 
 
 		 388 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  45.4 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  44.57 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  45.22 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  46.07 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  57.69 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.43 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.43 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.43 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.22 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.84 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  58.08 
 
 		 285 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.43 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.43 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  54.23 
 
 		 306 aa  289  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.42 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  46.2 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  53.41 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  53.97 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  53.41 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  58.61 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  45.48 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  45.48 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  45.48 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  52.4 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  53.88 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  53.05 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  46.44 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  57.2 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>