More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2476 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  75.14 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  73.76 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  73.48 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  67.93 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2771  Mrp/NBP35 family protein  70.64 
 
 		 362 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  72.38 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  62.47 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  60.16 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  49.86 
 
 		 375 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  46.96 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.9 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  47.38 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  46.98 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  47.25 
 
 		 370 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  48.06 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  46.32 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  48.6 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  45.53 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  47.35 
 
 		 384 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  45.63 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  46.34 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.27 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  46.3 
 
 		 387 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  46.72 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  46.03 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  46.24 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.5 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  47.71 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  45.81 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.09 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  46.7 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  45.73 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.71 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  56.45 
 
 		 358 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  56.45 
 
 		 358 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  47.66 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.5 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  45.79 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  44.83 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  46.07 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.13 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  58.37 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  45.83 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  45.92 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.63 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  44.85 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  46.33 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.22 
 
 		 362 aa  279  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.22 
 
 		 362 aa  279  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.29 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.56 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  44.54 
 
 		 363 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  46.87 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  43.4 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.44 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  44.54 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.1 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  47.08 
 
 		 365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  43.3 
 
 		 365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.26 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  42.82 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  44.9 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.54 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  44.64 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.12 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  45.45 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.87 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.24 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  53.78 
 
 		 371 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  53.95 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  55.56 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  43.45 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.05 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  53.91 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  43.37 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  52.73 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  46.5 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  49.27 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.21 
 
 		 348 aa  265  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  54.03 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  43.18 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  46.46 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.1 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.5 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.96 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.81 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.81 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  46.46 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  46.18 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  54.1 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  53.69 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>