More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3327 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  100 
 
 
415 aa  834    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  64.67 
 
 
376 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  64.05 
 
 
370 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  65.03 
 
 
372 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  61.56 
 
 
373 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  61.02 
 
 
394 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  63.44 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  60.26 
 
 
379 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  60.64 
 
 
364 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  58.54 
 
 
379 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  58.62 
 
 
361 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  58.25 
 
 
386 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  56.99 
 
 
384 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  58.99 
 
 
375 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  57.56 
 
 
374 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  55.13 
 
 
389 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  55.87 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  55.67 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  54.85 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  58.42 
 
 
378 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  57.82 
 
 
374 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  56.88 
 
 
373 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  57.4 
 
 
388 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  54.71 
 
 
382 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  55.7 
 
 
394 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  51.11 
 
 
364 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  54.42 
 
 
368 aa  353  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  54.18 
 
 
382 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  52.65 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  45.79 
 
 
357 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  50.79 
 
 
360 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  47.75 
 
 
354 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  48.88 
 
 
357 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  57.66 
 
 
358 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  57.66 
 
 
358 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  55.68 
 
 
363 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.05 
 
 
363 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.5 
 
 
363 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.44 
 
 
362 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  56.27 
 
 
374 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  56.51 
 
 
363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.17 
 
 
362 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  43.64 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.07 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  48.56 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  48.56 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  45.43 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  55.68 
 
 
363 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.44 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  57.89 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.88 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  57.58 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  56.62 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  41.42 
 
 
362 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  50.15 
 
 
362 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  56.55 
 
 
365 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  55.68 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  56.04 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  45.45 
 
 
363 aa  295  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.85 
 
 
363 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.61 
 
 
363 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46.09 
 
 
359 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.61 
 
 
363 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  55.68 
 
 
362 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  44.62 
 
 
371 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  55.88 
 
 
362 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.13 
 
 
363 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.13 
 
 
363 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.13 
 
 
363 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  56.57 
 
 
361 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  49.7 
 
 
363 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  56.75 
 
 
382 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  58.8 
 
 
363 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  53.85 
 
 
287 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  54.26 
 
 
306 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  56.18 
 
 
369 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  57.14 
 
 
285 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  53.68 
 
 
363 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  53.31 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  44.97 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  52.57 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  52.11 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  52.94 
 
 
373 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.09 
 
 
367 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  55.56 
 
 
361 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  48.23 
 
 
353 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.43 
 
 
363 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  45.79 
 
 
355 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  46.04 
 
 
388 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  48.23 
 
 
353 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46 
 
 
395 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  53.39 
 
 
370 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  54.09 
 
 
358 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  53.39 
 
 
370 aa  280  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  53.39 
 
 
370 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>