More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0923 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  100 
 
 		 386 aa  773    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  71.95 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  76.56 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  74.81 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  67.53 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  66.49 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  66.84 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  66.23 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  59.63 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  59.26 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  57.22 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  58.18 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  56.96 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  57.47 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  57.25 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  56.81 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  60.63 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  54.97 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  56.63 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  54.34 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  52.99 
 
 		 382 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  54.96 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  60.29 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  60.88 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  57.47 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  52.81 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  51.2 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  49.46 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  50.27 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  47.67 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  49.46 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  65.04 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  65.04 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  49.04 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  50.99 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  51.64 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  44.36 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.71 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.72 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.96 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  45.65 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.83 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  45.89 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.7 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.02 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  48.74 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  45.89 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  43.98 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  45.36 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.7 
 
 		 362 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.42 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  49.45 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  45.21 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  55.52 
 
 		 365 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  43.27 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  44.65 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  55.22 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  44.29 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  56.18 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  42.53 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  56.23 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  55.72 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.43 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.56 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  53.93 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.44 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  44.97 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.78 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.78 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  44.94 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  39.78 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  46.88 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  44.96 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  45.11 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  59.47 
 
 		 285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  43.38 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  60.48 
 
 		 369 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  60.48 
 
 		 369 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  60.48 
 
 		 369 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  60.48 
 
 		 369 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  44.69 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  60.08 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  52.81 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  55.98 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  44.53 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  46.07 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  44.33 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  44.41 
 
 		 369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  58.27 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>