More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1066 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 
364 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  73.35 
 
 
361 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  61.44 
 
 
379 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  59.57 
 
 
415 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  57.84 
 
 
387 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  59.89 
 
 
370 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  57.58 
 
 
394 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  58.51 
 
 
389 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  61.5 
 
 
375 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  57.95 
 
 
376 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  60.53 
 
 
378 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  60.11 
 
 
374 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  57.84 
 
 
373 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  59.42 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  58.27 
 
 
372 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  62.1 
 
 
373 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  56.72 
 
 
394 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  57.33 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  56.42 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  58.27 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  56.52 
 
 
394 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  57.14 
 
 
388 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  58.76 
 
 
374 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  55.41 
 
 
382 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  53.32 
 
 
382 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  54.49 
 
 
368 aa  364  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  50.71 
 
 
364 aa  361  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  52.93 
 
 
382 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  49.18 
 
 
357 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  50.29 
 
 
357 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  48.86 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  53.1 
 
 
360 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  54.33 
 
 
348 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  48.09 
 
 
363 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.37 
 
 
363 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  47.27 
 
 
363 aa  325  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  46.69 
 
 
362 aa  322  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  47.63 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  46.65 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  60.8 
 
 
358 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  60.8 
 
 
358 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.24 
 
 
362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.65 
 
 
362 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  49.45 
 
 
362 aa  316  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  49.45 
 
 
362 aa  316  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.7 
 
 
362 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  47.04 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  47.84 
 
 
363 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  46.87 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.67 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  46.85 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  49.57 
 
 
362 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  48.41 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  47.31 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  57.03 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  45.92 
 
 
362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46.42 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  46.67 
 
 
363 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  46.11 
 
 
365 aa  301  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  58.24 
 
 
365 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  43.11 
 
 
374 aa  300  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.35 
 
 
362 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  48.86 
 
 
355 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  46.63 
 
 
363 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  46.11 
 
 
363 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  43.68 
 
 
371 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  44.99 
 
 
370 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  44.99 
 
 
370 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  44.99 
 
 
370 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  55.6 
 
 
306 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  60.08 
 
 
362 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  53.79 
 
 
371 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 
353 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.11 
 
 
363 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.11 
 
 
363 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 
353 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  52.26 
 
 
355 aa  292  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  54.62 
 
 
286 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  59.26 
 
 
362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.74 
 
 
353 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.11 
 
 
363 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  55.17 
 
 
391 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.46 
 
 
353 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.43 
 
 
364 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  54.15 
 
 
388 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  45.89 
 
 
364 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  55.51 
 
 
382 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  45.03 
 
 
369 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  45.99 
 
 
369 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.81 
 
 
363 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.81 
 
 
363 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.83 
 
 
376 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  60 
 
 
363 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>