More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0581 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  100 
 
 
367 aa  722    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  67.93 
 
 
362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  68.29 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  67.84 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  68.29 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  63.24 
 
 
361 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  58.38 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  56.49 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2771  Mrp/NBP35 family protein  58.7 
 
 
362 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  45.31 
 
 
379 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.68 
 
 
375 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  46.07 
 
 
384 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  46.09 
 
 
376 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  44.38 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.78 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.62 
 
 
368 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.03 
 
 
382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.29 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46.03 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.02 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  43.56 
 
 
370 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  43.75 
 
 
394 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  43.97 
 
 
394 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.58 
 
 
373 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  44.44 
 
 
389 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.96 
 
 
372 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.74 
 
 
357 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  42.58 
 
 
363 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.92 
 
 
415 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  44.62 
 
 
386 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  43.99 
 
 
379 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  44.6 
 
 
364 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  44.54 
 
 
382 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  53.97 
 
 
358 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  53.97 
 
 
358 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.96 
 
 
362 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  54.88 
 
 
361 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.13 
 
 
363 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  45.06 
 
 
382 aa  288  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.13 
 
 
362 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  45.88 
 
 
360 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  44.87 
 
 
363 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  45.01 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  44.25 
 
 
364 aa  285  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  42.58 
 
 
363 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.31 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  46.89 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.77 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.07 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  54.17 
 
 
365 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  44.41 
 
 
394 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  41.76 
 
 
362 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  43.25 
 
 
362 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  43.25 
 
 
362 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  54.66 
 
 
374 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  45.86 
 
 
369 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  39.56 
 
 
362 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  42.47 
 
 
364 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  44.51 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  49.29 
 
 
363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.48 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  41.92 
 
 
363 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  41.76 
 
 
362 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  41.21 
 
 
363 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  42.66 
 
 
363 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  54.31 
 
 
285 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.54 
 
 
363 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  40.93 
 
 
362 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  39.39 
 
 
356 aa  270  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  41.64 
 
 
363 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  52.46 
 
 
391 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.54 
 
 
363 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  52.38 
 
 
361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  41.21 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.2 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.2 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  39.84 
 
 
363 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  44.38 
 
 
348 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  51.2 
 
 
373 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  43.48 
 
 
362 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  39.78 
 
 
367 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  43.73 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  53.36 
 
 
286 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  51 
 
 
371 aa  265  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.27 
 
 
363 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.23 
 
 
374 aa  264  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.27 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  42.73 
 
 
365 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.38 
 
 
362 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.19 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  51.98 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  39 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  51 
 
 
382 aa  262  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  40.38 
 
 
362 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1593  ATP/GTP-binding protein  39 
 
 
368 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  42.47 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.62 
 
 
376 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  39.62 
 
 
367 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  40.76 
 
 
367 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  41.95 
 
 
353 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>