More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0246 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 
367 aa  744    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1593  ATP/GTP-binding protein  79.46 
 
 
368 aa  614  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  79.73 
 
 
368 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1778  ATP/GTP-binding protein  79.19 
 
 
368 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  73.22 
 
 
366 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  72.95 
 
 
366 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0411  Mrp protein  70.52 
 
 
358 aa  528  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169995  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  67.41 
 
 
356 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  62.97 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  57.49 
 
 
368 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  39.15 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  41.48 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  39.73 
 
 
387 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.53 
 
 
357 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.58 
 
 
363 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  39.73 
 
 
394 aa  279  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  40.34 
 
 
358 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  40.34 
 
 
358 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.65 
 
 
348 aa  269  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  37.5 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  40.91 
 
 
360 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  41.76 
 
 
358 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  41.84 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  41.28 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  40.12 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  41.72 
 
 
361 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  43.7 
 
 
357 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  38.65 
 
 
386 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  39.94 
 
 
358 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  39.42 
 
 
360 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  39.89 
 
 
370 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  39.89 
 
 
370 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  39.89 
 
 
370 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  42.23 
 
 
356 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  38.89 
 
 
362 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  41.91 
 
 
357 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  41.94 
 
 
356 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  47.6 
 
 
373 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  39.07 
 
 
364 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.03 
 
 
363 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  39.12 
 
 
351 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  38.37 
 
 
358 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.2 
 
 
375 aa  255  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  47.13 
 
 
358 aa  255  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  40.58 
 
 
373 aa  255  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  39.76 
 
 
357 aa  255  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  40.58 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46.8 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  41.14 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  39.77 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  40.06 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.59 
 
 
362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  39.3 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  49.59 
 
 
373 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  38.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  39.77 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  37.67 
 
 
395 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  47.81 
 
 
369 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  38.9 
 
 
369 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  39.47 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.77 
 
 
358 aa  252  8.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.59 
 
 
305 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  38.9 
 
 
357 aa  252  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  37.83 
 
 
363 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  40.22 
 
 
365 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  47.83 
 
 
382 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  47.01 
 
 
369 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  38.21 
 
 
388 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  47.01 
 
 
369 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  48.09 
 
 
360 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  39.59 
 
 
353 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  38.07 
 
 
394 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  39.6 
 
 
364 aa  249  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.97 
 
 
367 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.29 
 
 
363 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.29 
 
 
363 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  49.06 
 
 
394 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.15 
 
 
362 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  38.61 
 
 
362 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  40.35 
 
 
336 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.99 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  39.18 
 
 
363 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.7 
 
 
363 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.56 
 
 
415 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  40.8 
 
 
364 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  42.3 
 
 
368 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  39.77 
 
 
369 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  40.35 
 
 
363 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  37.28 
 
 
354 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.41 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  37.83 
 
 
370 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  44.1 
 
 
370 aa  245  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.473221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>