More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1927 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  100 
 
 
360 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  85.11 
 
 
358 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  76.14 
 
 
358 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  70.2 
 
 
357 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  63.14 
 
 
367 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  63.14 
 
 
361 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  58.77 
 
 
356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  58.5 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  57.66 
 
 
356 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  56.9 
 
 
355 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  56.41 
 
 
361 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  55 
 
 
353 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  52.78 
 
 
353 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  54.72 
 
 
353 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  54.19 
 
 
356 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  53.85 
 
 
356 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  51.68 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  53.94 
 
 
356 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.38 
 
 
367 aa  298  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  42.78 
 
 
359 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  43.63 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  41.73 
 
 
384 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  42.61 
 
 
336 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  53.28 
 
 
367 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.65 
 
 
367 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  41.55 
 
 
368 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  39.83 
 
 
365 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  51.14 
 
 
387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  51.14 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  42.82 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  53.12 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  40.06 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  40.35 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  39.39 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  41.06 
 
 
368 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.64 
 
 
375 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  40.91 
 
 
367 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  40.22 
 
 
363 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  41.46 
 
 
376 aa  265  8.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  41.86 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.62 
 
 
382 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  41.01 
 
 
378 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  41.86 
 
 
368 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  49.03 
 
 
367 aa  262  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  40.52 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0411  Mrp protein  41.46 
 
 
358 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169995  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  41.9 
 
 
366 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  41.18 
 
 
354 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  40.58 
 
 
375 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  40.35 
 
 
371 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.22 
 
 
305 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1593  ATP/GTP-binding protein  40.23 
 
 
368 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  50.38 
 
 
372 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  51.33 
 
 
373 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  40.06 
 
 
363 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  48.75 
 
 
363 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  52.21 
 
 
361 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  52.9 
 
 
415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  51.52 
 
 
394 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1778  ATP/GTP-binding protein  39.94 
 
 
368 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  52.11 
 
 
364 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.48 
 
 
395 aa  258  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.49 
 
 
358 aa  258  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  40.51 
 
 
363 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  42.15 
 
 
379 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  41.08 
 
 
376 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  40.4 
 
 
366 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  40.6 
 
 
382 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
388 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  49.26 
 
 
372 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.57 
 
 
351 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  50.19 
 
 
368 aa  255  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.88 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.32 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  49.42 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  48.63 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  49.42 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 
360 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  52.59 
 
 
374 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  41.98 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  41.81 
 
 
357 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  39.33 
 
 
366 aa  252  6e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  37.57 
 
 
357 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  40.88 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  44.7 
 
 
364 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  50.8 
 
 
354 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
298 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  44.23 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.13 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  48.02 
 
 
356 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  50 
 
 
382 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
362 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  53.71 
 
 
374 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.9 
 
 
358 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.06 
 
 
363 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.85 
 
 
362 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  38.83 
 
 
363 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  37.61 
 
 
357 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.13 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.85 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>