More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2325 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
367 aa  729    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  47.03 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  49.44 
 
 
353 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  46.74 
 
 
367 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  46.96 
 
 
368 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  50.14 
 
 
373 aa  344  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  47.41 
 
 
367 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  50.71 
 
 
353 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  50.57 
 
 
353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  47.12 
 
 
376 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.86 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.84 
 
 
395 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  49.44 
 
 
361 aa  332  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  45.48 
 
 
357 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  44.54 
 
 
368 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  47.24 
 
 
363 aa  328  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.82 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  46.17 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  48.44 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  50.14 
 
 
359 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  45.9 
 
 
376 aa  322  8e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  50.85 
 
 
356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  48.61 
 
 
356 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  51.03 
 
 
356 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  46.93 
 
 
367 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  47.06 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.38 
 
 
298 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  45.4 
 
 
357 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  42.78 
 
 
356 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.75 
 
 
305 aa  298  8e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  45.38 
 
 
360 aa  298  9e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  45.45 
 
 
358 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  42.62 
 
 
357 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.92 
 
 
371 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  47.74 
 
 
358 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  43.02 
 
 
370 aa  294  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  42.21 
 
 
356 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  44.35 
 
 
368 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  46.42 
 
 
357 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  45.26 
 
 
379 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.27 
 
 
382 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  45.48 
 
 
384 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  48.13 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  47.74 
 
 
364 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  40.8 
 
 
355 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.37 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  47.66 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.39 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  54.92 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.3 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.53 
 
 
348 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.6 
 
 
387 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  43.09 
 
 
373 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.58 
 
 
364 aa  279  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  43.01 
 
 
370 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.66 
 
 
358 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.66 
 
 
358 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  42.35 
 
 
394 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  44.51 
 
 
368 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  42.22 
 
 
358 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.63 
 
 
358 aa  275  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  41.67 
 
 
364 aa  275  7e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  42.49 
 
 
354 aa  275  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  46.65 
 
 
358 aa  275  9e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.8 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  45.37 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.74 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  53.73 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.82 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  48.53 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  48.53 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.79 
 
 
374 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.43 
 
 
354 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  54.07 
 
 
373 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  43.39 
 
 
363 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  54.12 
 
 
375 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  53.73 
 
 
378 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  52.33 
 
 
382 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  54.18 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  46.29 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  46.29 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  43.84 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.2 
 
 
363 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 
362 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  46 
 
 
361 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  43.66 
 
 
382 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.57 
 
 
362 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  51.49 
 
 
368 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.52 
 
 
376 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  52.42 
 
 
372 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  46.49 
 
 
345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  54.44 
 
 
347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  44.07 
 
 
361 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  44.92 
 
 
361 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.95 
 
 
363 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  43.98 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  41.16 
 
 
362 aa  265  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.25 
 
 
363 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.25 
 
 
363 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.19 
 
 
363 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>