More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2457 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  771    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  55.91 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  53.67 
 
 		 387 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  55.13 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  53.42 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  54.29 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  52.85 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  53.83 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  55.41 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  54.62 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  53.56 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  52.79 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  51.59 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  55.28 
 
 		 370 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  52.36 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  54.86 
 
 		 372 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  50.56 
 
 		 354 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  52.16 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  53.49 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  52.19 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  52.39 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  55.14 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  51.69 
 
 		 386 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  51.05 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  51.83 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  47.52 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  53.04 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.6 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  48.17 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  48.17 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  49.3 
 
 		 357 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  49.46 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.17 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.63 
 
 		 363 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.91 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  51.41 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  45 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  49.86 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  47.89 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.7 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.75 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.77 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  48.42 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  47.85 
 
 		 363 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  47.93 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.33 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  47.23 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  47.23 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.39 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  45.53 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.33 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  59.02 
 
 		 363 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  51.59 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  45.48 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  47.09 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  47.09 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  47.09 
 
 		 363 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.83 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  46.68 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  46.68 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0179  GTP/ATP binding protein, putative  47.51 
 
 		 340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  45.62 
 
 		 361 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  46.58 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  53.48 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.48 
 
 		 362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.7 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.66 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  47.48 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  56.04 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.69 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.41 
 
 		 353 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  58.33 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  40.32 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  45.77 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.95 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  56.92 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.11 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  58.23 
 
 		 285 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.11 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  54.8 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.01 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 		 363 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 		 363 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  45.11 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  43.22 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  47.65 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  56.97 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  56.05 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  56.05 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  56.05 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  42.01 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  56.57 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  40.98 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  53.48 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  56.57 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  42.47 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  48.61 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0825  hypothetical protein  40.38 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>