More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2048 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  95.43 
 
 		 372 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  86.49 
 
 		 370 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 372 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  77.54 
 
 		 376 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  81.18 
 
 		 373 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  73.94 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  71.66 
 
 		 379 aa  527  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  62.5 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  62.3 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  58.62 
 
 		 389 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  58.02 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  60.38 
 
 		 384 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  58.54 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  59.25 
 
 		 375 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  57.38 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  57.57 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  58.82 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  57.71 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  56.88 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  57.49 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  58.36 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  58.29 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  56.65 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  60.98 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  52.97 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  55.14 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  54.04 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  57.74 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  53.01 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  47.06 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  45.11 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  46.83 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  59.06 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  59.06 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.38 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 		 363 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.56 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  47.26 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.41 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  46.9 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  45.68 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.01 
 
 		 362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  44.35 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.69 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  43.9 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  45.18 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.82 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  49.04 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  43.36 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  47.9 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 		 362 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  45.77 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  46.34 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  54.4 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.83 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.83 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  58.4 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.23 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  44.63 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.7 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  53.39 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  47.78 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.25 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  57.32 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  56 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  55.26 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  44.38 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  56.5 
 
 		 362 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  53.85 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  46.94 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.09 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.71 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  55.73 
 
 		 371 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  46.67 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.09 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  55.51 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  53.52 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  58.08 
 
 		 285 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  54.09 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  53.57 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  53.57 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.81 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  53.7 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.28 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  53.57 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  45.83 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  57.61 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  47.35 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  53.7 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.84 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  43.7 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  57.61 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  57.2 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>