More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42355 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  51.15 
 
 
357 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  54.8 
 
 
382 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  47.85 
 
 
354 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  55.6 
 
 
364 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  53.36 
 
 
375 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.99 
 
 
362 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  52.16 
 
 
379 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  53.39 
 
 
362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  56.1 
 
 
361 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  54.22 
 
 
389 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  52.42 
 
 
358 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.99 
 
 
362 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  54.55 
 
 
363 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  52.42 
 
 
358 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  55.28 
 
 
373 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  54.98 
 
 
378 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07525  nucleotide binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09810)  46.06 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.463986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  54.22 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  50.9 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  54.22 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  54.37 
 
 
415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  50.94 
 
 
372 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  50.97 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  53.41 
 
 
371 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  54.03 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  49.45 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  53.57 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  53.75 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  53.75 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  52.92 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  50.56 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  53.41 
 
 
362 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  52.96 
 
 
363 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  50.2 
 
 
362 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  52.38 
 
 
363 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  51.78 
 
 
364 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  52.19 
 
 
363 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  52.57 
 
 
365 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  53.56 
 
 
348 aa  279  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  54.15 
 
 
374 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  52.17 
 
 
373 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  50.79 
 
 
354 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  50.6 
 
 
363 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  51.59 
 
 
363 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  51.61 
 
 
374 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  48.74 
 
 
394 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  52.49 
 
 
361 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  52.99 
 
 
362 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  51.41 
 
 
365 aa  276  4e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  52.85 
 
 
368 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  53.15 
 
 
363 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  51 
 
 
362 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  52.76 
 
 
363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  52.99 
 
 
374 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  49.09 
 
 
379 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.89 
 
 
371 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  52.17 
 
 
362 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  52.76 
 
 
363 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  52.17 
 
 
362 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  50.79 
 
 
355 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  52.02 
 
 
286 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  52.36 
 
 
373 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  51.78 
 
 
362 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
363 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  51 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.02 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  53.2 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  50.99 
 
 
363 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  50.6 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.52 
 
 
373 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.52 
 
 
371 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.52 
 
 
371 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.52 
 
 
371 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  52.17 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  51.19 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.6 
 
 
376 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.89 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.36 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  52.19 
 
 
369 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  51.98 
 
 
363 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  52.4 
 
 
362 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.89 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.89 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  51.6 
 
 
356 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  51.89 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  52.81 
 
 
360 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  51.39 
 
 
369 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  51.79 
 
 
369 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>