More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1978 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  84.64 
 
 		 371 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  94.41 
 
 		 371 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  83.56 
 
 		 371 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  83.56 
 
 		 371 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  83.56 
 
 		 371 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  85.18 
 
 		 371 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  85.44 
 
 		 371 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  83.56 
 
 		 371 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  85.44 
 
 		 371 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  84.64 
 
 		 373 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  100 
 
 		 371 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  79.51 
 
 		 371 aa  624  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1574  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  86.52 
 
 		 370 aa  617  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1918  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  80.32 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  73.5 
 
 		 370 aa  547  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  64.88 
 
 		 376 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  55.56 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.46 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  57.49 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  54.6 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  53.06 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  54.71 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  54.3 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  55.02 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  54.3 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  55.75 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.18 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  55.92 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  55.09 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  52.81 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  54.09 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  55.18 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  56.14 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  53.09 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  53.35 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  53.35 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  53.35 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  53.35 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  54.17 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1196  putative ATPase  55.2 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  55.32 
 
 		 363 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  54.21 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  51.41 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  53.12 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  53.55 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  55.69 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  55.69 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  53.93 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  52.71 
 
 		 374 aa  358  6e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  55.62 
 
 		 362 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.46 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.92 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  48.87 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  53.65 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  48.87 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  48.87 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  55.13 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  52.75 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.46 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  51.69 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.44 
 
 		 363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  54.3 
 
 		 363 aa  355  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  54.84 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.17 
 
 		 363 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  53.09 
 
 		 364 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.17 
 
 		 363 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  53.67 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  52.8 
 
 		 362 aa  352  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  52.53 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.53 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  52.53 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  55.99 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  56.96 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  52.54 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  53.35 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  54.73 
 
 		 363 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  55.7 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  53.01 
 
 		 363 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  55.85 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  52.02 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  52.4 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  55.38 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  53.63 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  53.67 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  52.58 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>