More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2227 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  727    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  58.97 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  57.64 
 
 		 382 aa  434  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02926  hypothetical protein  58.97 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  54.37 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  52.23 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  53.52 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  54.08 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  52.1 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  52.23 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  52.23 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  52.23 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1196  putative ATPase  55.3 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  52.23 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  54.44 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  53.58 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  61.25 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  61.25 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  62.82 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  61.25 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  52.84 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  59.18 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  60.63 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  50 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  52.92 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.22 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  49.42 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.56 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  58.74 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.56 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.16 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.16 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.16 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  60.16 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.56 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.56 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.56 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  59.18 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  59.44 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  61.22 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.96 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  58.63 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  62.45 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.41 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  61.63 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  60.41 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.16 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  62.45 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.63 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.64 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  61.04 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  50.5 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.23 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.84 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  50.59 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  59.62 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  64.07 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  56.15 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  47.41 
 
 		 362 aa  312  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  57.62 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  61.22 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  55.4 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.49 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  60.41 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2397  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.4 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.183831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  60.08 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  47.16 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  47.71 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.68 
 
 		 408 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  57.2 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1624  putative ATPase  60.31 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.55961  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  45.64 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  45.64 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  60.56 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  60.56 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.08 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  59.68 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  60.41 
 
 		 363 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  60 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  62.04 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  59.44 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>