More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2500 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  99.73 
 
 
369 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  100 
 
 
369 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  100 
 
 
369 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  100 
 
 
369 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  100 
 
 
369 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  89.7 
 
 
369 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  96.21 
 
 
369 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  79.4 
 
 
369 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  78.86 
 
 
369 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  78.05 
 
 
369 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1196  putative ATPase  79.95 
 
 
369 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  78.85 
 
 
370 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  75.68 
 
 
370 aa  596  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  75.68 
 
 
370 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  75.68 
 
 
370 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  64.57 
 
 
373 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  56.13 
 
 
358 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  53.85 
 
 
388 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  61.87 
 
 
355 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.52 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  55.14 
 
 
382 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  50.56 
 
 
371 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  57.5 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.45 
 
 
362 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.35 
 
 
371 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.59 
 
 
363 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.35 
 
 
371 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.59 
 
 
363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.59 
 
 
363 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  53.76 
 
 
363 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02926  hypothetical protein  54.37 
 
 
364 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
363 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
363 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 
363 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  52.29 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.29 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.29 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.29 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.71 
 
 
371 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  53.24 
 
 
361 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.71 
 
 
373 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.71 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.71 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.71 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  52.89 
 
 
363 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  53.48 
 
 
391 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.3 
 
 
370 aa  348  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  50.29 
 
 
363 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  55.29 
 
 
363 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  56.37 
 
 
362 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  51.54 
 
 
363 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  49.56 
 
 
362 aa  346  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  52.37 
 
 
365 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.55 
 
 
376 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.94 
 
 
362 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  51.34 
 
 
362 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  53.3 
 
 
376 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  51.38 
 
 
363 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.93 
 
 
362 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  50.44 
 
 
365 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  50.43 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  55.73 
 
 
362 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  52.16 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  47.81 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1624  putative ATPase  55.99 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.55961  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  55.41 
 
 
362 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1574  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.64 
 
 
370 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69151  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  53.99 
 
 
362 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  49.85 
 
 
362 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  50.44 
 
 
362 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  50.44 
 
 
362 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  51.52 
 
 
363 aa  328  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  48.16 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1918  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.31 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  58.4 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  50.73 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  50.73 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  60 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  50.75 
 
 
363 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  63.86 
 
 
364 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  50.88 
 
 
363 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  50.46 
 
 
365 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  51.18 
 
 
363 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  58.85 
 
 
286 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  53.07 
 
 
362 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  50.14 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  49.86 
 
 
363 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>