More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2838 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  100 
 
 		 391 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  56.25 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  55.7 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1196  putative ATPase  57.91 
 
 		 369 aa  348  9e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  53.48 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  55.03 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  56.51 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  54.11 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  54.11 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  54.11 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  54.72 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.82 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  54.4 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  64.11 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  53.48 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  53.48 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  53.48 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  53.48 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.33 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  48.19 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  64.06 
 
 		 363 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  64.94 
 
 		 371 aa  338  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.89 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.02 
 
 		 371 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.45 
 
 		 371 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  63.31 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.87 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.87 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.87 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.73 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  64.08 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.02 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.73 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  51.73 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  62.7 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  62.7 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.67 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  49.29 
 
 		 355 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.67 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  63.24 
 
 		 365 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 		 363 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  51.9 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  62 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.9 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.48 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.49 
 
 		 376 aa  326  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  51.89 
 
 		 373 aa  326  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.27 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  46.65 
 
 		 382 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  63.67 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  62.11 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  61.69 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  58.96 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  59.23 
 
 		 286 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  60.24 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  59.85 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  60.94 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  59.85 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  48.75 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  48.75 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  63.27 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  48.25 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1574  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.83 
 
 		 370 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.3 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  62.86 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  61.89 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  50.96 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1918  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.77 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  50.96 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  50.47 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.13 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  54.29 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  60.47 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  64.11 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  60.48 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  59.84 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  60.82 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  57.58 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  60.82 
 
 		 363 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  58.87 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  63.44 
 
 		 285 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  58.47 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  60.94 
 
 		 363 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  56.82 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  59.52 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>