More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0395 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  100 
 
 
354 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  71.15 
 
 
357 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  62.47 
 
 
362 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  60.89 
 
 
355 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  61.06 
 
 
353 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  60.78 
 
 
353 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  56.49 
 
 
367 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  50.56 
 
 
382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  58.79 
 
 
361 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2771  Mrp/NBP35 family protein  55.34 
 
 
362 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  50 
 
 
375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.81 
 
 
378 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  46.51 
 
 
387 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  47.24 
 
 
379 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  46.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  48.85 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  46.61 
 
 
389 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  48.31 
 
 
373 aa  338  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  49.58 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.43 
 
 
382 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  50 
 
 
363 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  50 
 
 
361 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  49.57 
 
 
362 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  49.57 
 
 
362 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  49.57 
 
 
363 aa  332  8e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  45.74 
 
 
357 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  48.29 
 
 
364 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  49 
 
 
363 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  47.67 
 
 
386 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  50.43 
 
 
363 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  49.14 
 
 
364 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  45.03 
 
 
384 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.21 
 
 
415 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  44.78 
 
 
370 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  46.76 
 
 
374 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  48.98 
 
 
358 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  48.98 
 
 
358 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.99 
 
 
376 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.53 
 
 
363 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  49.43 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  44.78 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  45.56 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  48.71 
 
 
362 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  50 
 
 
363 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  44.63 
 
 
382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
363 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.08 
 
 
368 aa  316  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.38 
 
 
362 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  48.55 
 
 
363 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  47.08 
 
 
371 aa  315  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  47.32 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  44.84 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  47.14 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.28 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.96 
 
 
362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.56 
 
 
362 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.82 
 
 
362 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  45.22 
 
 
364 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  46.53 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  50.61 
 
 
365 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  46.29 
 
 
362 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  47.32 
 
 
362 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  49.29 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  43.13 
 
 
394 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  44.15 
 
 
388 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  48.56 
 
 
362 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  46.42 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.57 
 
 
372 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  47.71 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46.05 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  43.35 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  48.31 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  47.46 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  47.03 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  48 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  44.38 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.58 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.58 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.58 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  47.09 
 
 
365 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  47.79 
 
 
371 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.79 
 
 
371 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  46.7 
 
 
388 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.06 
 
 
371 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.79 
 
 
371 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.79 
 
 
371 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.58 
 
 
363 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.58 
 
 
363 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.35 
 
 
371 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.99 
 
 
362 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  44.06 
 
 
373 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42355  conserved nucleotide binding protein  47.85 
 
 
306 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.92544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  44.99 
 
 
362 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  43.06 
 
 
364 aa  295  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  46.82 
 
 
364 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.2 
 
 
371 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.2 
 
 
373 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.99 
 
 
376 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  44.86 
 
 
364 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>