More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7302 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  100 
 
 
374 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  90.11 
 
 
374 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  76.98 
 
 
375 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  72.94 
 
 
378 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  74.73 
 
 
373 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  70.39 
 
 
382 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  60.55 
 
 
370 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  59.95 
 
 
376 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  59.3 
 
 
364 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  57.25 
 
 
384 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  57.53 
 
 
373 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  57.22 
 
 
394 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  54.94 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  57.26 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  58.73 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  54.68 
 
 
394 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  57.67 
 
 
379 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  56.45 
 
 
361 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  57.82 
 
 
372 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  57.82 
 
 
372 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  54.45 
 
 
389 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  55.64 
 
 
388 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  54.34 
 
 
386 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  54.89 
 
 
394 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  52.62 
 
 
382 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  51.99 
 
 
364 aa  344  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  48.03 
 
 
354 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  48.81 
 
 
382 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  45.7 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  51.43 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.76 
 
 
363 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  46.09 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  50.57 
 
 
368 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.79 
 
 
363 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.76 
 
 
362 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.45 
 
 
362 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  48.17 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  49.73 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.54 
 
 
362 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.8 
 
 
362 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  47.59 
 
 
365 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  45.6 
 
 
362 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  46.48 
 
 
363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.63 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  59.35 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  59.35 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.3 
 
 
363 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  47.61 
 
 
363 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  51.57 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  47.5 
 
 
374 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.51 
 
 
362 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  47.88 
 
 
369 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  54.07 
 
 
362 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.44 
 
 
363 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  58.52 
 
 
365 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  46.76 
 
 
363 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  45.83 
 
 
361 aa  299  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  51.78 
 
 
363 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.75 
 
 
353 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  57.03 
 
 
364 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.47 
 
 
353 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.16 
 
 
363 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.16 
 
 
363 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.16 
 
 
363 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  48.2 
 
 
363 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.16 
 
 
363 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  47.92 
 
 
363 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.16 
 
 
363 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46.5 
 
 
359 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  48.75 
 
 
355 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  47.63 
 
 
363 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  53.1 
 
 
388 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  47.38 
 
 
362 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.31 
 
 
376 aa  291  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  44.27 
 
 
362 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  46.08 
 
 
370 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  46.08 
 
 
370 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  46.08 
 
 
370 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.21 
 
 
362 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.21 
 
 
362 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  48.21 
 
 
369 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  48.21 
 
 
369 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  48.21 
 
 
369 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  48.21 
 
 
369 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  46.43 
 
 
362 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  48.86 
 
 
363 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  59.51 
 
 
363 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  54.9 
 
 
371 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  48.06 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  45.89 
 
 
362 aa  289  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  43.65 
 
 
371 aa  289  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  53.39 
 
 
369 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>