More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2093 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  99.72 
 
 		 353 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  100 
 
 		 353 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  92.11 
 
 		 355 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  73.48 
 
 		 362 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  68.29 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  69.34 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2771  Mrp/NBP35 family protein  65.56 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  62.57 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  60.78 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  49.58 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.98 
 
 		 378 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  48.49 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  47.89 
 
 		 373 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  49.03 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  45.75 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  46.96 
 
 		 379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  47.65 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  45.48 
 
 		 394 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  48.2 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  45.78 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  48.48 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  45.6 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  48.57 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  45.68 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  45.88 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.72 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  48.48 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  48.04 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.67 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  47.41 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.44 
 
 		 363 aa  302  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  46.52 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  48 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.67 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.43 
 
 		 362 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.86 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  47.14 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  54.26 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  48.3 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.21 
 
 		 379 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  48.93 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  50.3 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  49.69 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  49.69 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  48.3 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  47.86 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  45.97 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  48.94 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  48.44 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  47.29 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  47.29 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  44.84 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  46.54 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  44.13 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  47.29 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  46.54 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.01 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.17 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.01 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  46 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  47.38 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  43.85 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.72 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  46.44 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  50.83 
 
 		 360 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  44.22 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  46.44 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  45.38 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.31 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  45.45 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  47.71 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.44 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.09 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  55.87 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.45 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  44.13 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  46.44 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.94 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.45 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.51 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  47.27 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  44.86 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  52.21 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.96 
 
 		 376 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.71 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.93 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.93 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  45.93 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.93 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  52.02 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  54.84 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  45.43 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  55.42 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>