More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3343 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  715    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  50.84 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  49.86 
 
 
354 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  46.67 
 
 
379 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  44.5 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  44.89 
 
 
394 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.89 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  47.11 
 
 
373 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  46.99 
 
 
384 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  45.95 
 
 
375 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  46.37 
 
 
357 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  45.43 
 
 
378 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  45.63 
 
 
373 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  44.84 
 
 
394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  45.11 
 
 
382 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  46.15 
 
 
364 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  42.42 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.04 
 
 
376 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  44.96 
 
 
386 aa  279  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 
388 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  45.18 
 
 
370 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  44.96 
 
 
415 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  43.3 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  43.87 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  43.47 
 
 
368 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.54 
 
 
374 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.98 
 
 
363 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  42.63 
 
 
394 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  42.4 
 
 
382 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.45 
 
 
372 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  41.67 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  47.67 
 
 
355 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.13 
 
 
358 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.13 
 
 
358 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  40.9 
 
 
363 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  47.66 
 
 
362 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  38.9 
 
 
357 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  44.19 
 
 
363 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.18 
 
 
359 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  42.15 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  46.79 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  38.9 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.66 
 
 
357 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.61 
 
 
358 aa  265  7e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.54 
 
 
372 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.67 
 
 
353 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  38.63 
 
 
356 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.38 
 
 
353 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.74 
 
 
362 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.19 
 
 
357 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.9 
 
 
305 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  45.16 
 
 
367 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  41.78 
 
 
360 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.57 
 
 
367 aa  262  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.66 
 
 
361 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  42.37 
 
 
362 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 
360 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  42.15 
 
 
353 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.23 
 
 
362 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  42.58 
 
 
362 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.73 
 
 
364 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  40 
 
 
347 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.43 
 
 
367 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  42.15 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  51.64 
 
 
361 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  44.07 
 
 
365 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  41.42 
 
 
358 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  42.98 
 
 
358 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  56.12 
 
 
285 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.13 
 
 
395 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  40.9 
 
 
363 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  45.86 
 
 
367 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  44.61 
 
 
348 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  41.19 
 
 
362 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  45.59 
 
 
287 aa  256  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  41.23 
 
 
363 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  39.84 
 
 
368 aa  255  7e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  52.63 
 
 
365 aa  255  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  37.15 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  44.07 
 
 
362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  42.94 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.47 
 
 
363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  41.55 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  41.55 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  42.82 
 
 
365 aa  252  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  42.74 
 
 
363 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  40.11 
 
 
353 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  52.08 
 
 
363 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  42.15 
 
 
363 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  52.28 
 
 
358 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.98 
 
 
362 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  42.54 
 
 
376 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  36.62 
 
 
367 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.84 
 
 
376 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  43.11 
 
 
366 aa  247  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  42.12 
 
 
363 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  43.73 
 
 
366 aa  246  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  50.79 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  43.45 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.13 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>