More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0420 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
360 aa  738    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  77.71 
 
 
357 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  74.93 
 
 
363 aa  545  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  67.81 
 
 
395 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  71.31 
 
 
368 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.64 
 
 
298 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  71.16 
 
 
305 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  53.33 
 
 
368 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  53.85 
 
 
367 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  54.85 
 
 
365 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  50.69 
 
 
368 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  49.18 
 
 
367 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  52.66 
 
 
356 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  49.59 
 
 
366 aa  342  5e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  49.86 
 
 
361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  49.3 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  49.3 
 
 
353 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  52.16 
 
 
359 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  49.58 
 
 
367 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  49.01 
 
 
367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  50.71 
 
 
364 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.44 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  47.43 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  51.11 
 
 
356 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  50.56 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  47.88 
 
 
370 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  51.53 
 
 
356 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  49.29 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  46.89 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  46.11 
 
 
364 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  46.42 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.84 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  47.46 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.19 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  45.76 
 
 
362 aa  302  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.28 
 
 
362 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.13 
 
 
363 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  47.21 
 
 
363 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  47.26 
 
 
362 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  47.67 
 
 
363 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  44.89 
 
 
357 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  49.29 
 
 
349 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.13 
 
 
363 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  47.55 
 
 
362 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.14 
 
 
358 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.44 
 
 
363 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  48.72 
 
 
358 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  42.44 
 
 
379 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  48.85 
 
 
361 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  48.85 
 
 
361 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.25 
 
 
348 aa  291  9e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.18 
 
 
363 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.18 
 
 
363 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  47.53 
 
 
351 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  47.46 
 
 
365 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  44.15 
 
 
347 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  48.56 
 
 
361 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  44.7 
 
 
361 aa  288  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  45.89 
 
 
363 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  47.78 
 
 
363 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  47.69 
 
 
363 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.6 
 
 
387 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  42.6 
 
 
394 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.41 
 
 
362 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  47.69 
 
 
363 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.97 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  43.54 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  43.54 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.38 
 
 
362 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.38 
 
 
362 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  46.99 
 
 
362 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.01 
 
 
382 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  47.26 
 
 
361 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.71 
 
 
362 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.97 
 
 
363 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.97 
 
 
363 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  45.56 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  47.38 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  47.35 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  43.91 
 
 
388 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  46.67 
 
 
374 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  43.06 
 
 
438 aa  282  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.89 
 
 
372 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  47.38 
 
 
363 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  45.56 
 
 
363 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  43.84 
 
 
371 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  47.4 
 
 
363 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.35 
 
 
389 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  45.53 
 
 
363 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  58.05 
 
 
358 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  43.47 
 
 
384 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  44.57 
 
 
365 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  43.25 
 
 
373 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  55.21 
 
 
368 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  42.49 
 
 
364 aa  275  9e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  47.44 
 
 
374 aa  275  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  42.44 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  43.37 
 
 
376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.4 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>