More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1234 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  749    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.43 
 
 
356 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  49.85 
 
 
371 aa  339  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  48.39 
 
 
359 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  48.73 
 
 
357 aa  328  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  47.56 
 
 
363 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.59 
 
 
353 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.59 
 
 
353 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  47.88 
 
 
360 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.72 
 
 
395 aa  318  9e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  45.66 
 
 
353 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  48.6 
 
 
365 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  45.22 
 
 
361 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44.8 
 
 
364 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  47.11 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  46.42 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  46.41 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.86 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.1 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  46.29 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  42.17 
 
 
367 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  45.99 
 
 
361 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  45.99 
 
 
361 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  45.7 
 
 
361 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  47.4 
 
 
356 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.19 
 
 
362 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  46.7 
 
 
368 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  44.84 
 
 
368 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.02 
 
 
367 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  43.71 
 
 
362 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  46.05 
 
 
368 aa  293  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.22 
 
 
362 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.1 
 
 
363 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  45.38 
 
 
367 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.41 
 
 
363 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.29 
 
 
362 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.16 
 
 
348 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.02 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
362 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.18 
 
 
357 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  46.09 
 
 
349 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  41.86 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.82 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  47.06 
 
 
366 aa  286  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
345 aa  285  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  42.94 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  44.61 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.95 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  46.55 
 
 
363 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  45.17 
 
 
374 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  46.87 
 
 
363 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37610  predicted protein  42.73 
 
 
462 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00176951  normal  0.0190501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  42.69 
 
 
365 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  43.55 
 
 
358 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  43.55 
 
 
358 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  44.12 
 
 
370 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  41.67 
 
 
363 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  44.12 
 
 
370 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  44.12 
 
 
370 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  40.35 
 
 
387 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  40.1 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  47.51 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  40.05 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  43.67 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.4 
 
 
376 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  43.95 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  42.62 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  43.86 
 
 
363 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  40.54 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  43.95 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  41.81 
 
 
362 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  41.81 
 
 
362 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  42.73 
 
 
362 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  44.31 
 
 
382 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  41.54 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  44.18 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  43.35 
 
 
373 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  43.88 
 
 
369 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  41.03 
 
 
365 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  41.35 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  44.61 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  42.69 
 
 
369 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  40.72 
 
 
364 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  40.84 
 
 
336 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  45.06 
 
 
368 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.36 
 
 
298 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  40.34 
 
 
364 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  40.36 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  41.05 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  40.9 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  41.37 
 
 
364 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.18 
 
 
382 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  42.47 
 
 
388 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  41.45 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.77 
 
 
370 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  41.88 
 
 
361 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  40.18 
 
 
438 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  41.02 
 
 
364 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  49 
 
 
368 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>