More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0926 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  100 
 
 
367 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  69.48 
 
 
368 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  64.46 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  63.01 
 
 
365 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  58.94 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  54.29 
 
 
366 aa  408  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  55.23 
 
 
363 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.85 
 
 
372 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  54.42 
 
 
357 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53 
 
 
395 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  53.85 
 
 
360 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  48.49 
 
 
376 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  49.73 
 
 
376 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  50 
 
 
373 aa  358  6e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  52.99 
 
 
368 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.74 
 
 
367 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  48.87 
 
 
361 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.44 
 
 
356 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  47.74 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  47.34 
 
 
367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  46.7 
 
 
353 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  50 
 
 
356 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  47.32 
 
 
367 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  47.03 
 
 
359 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  47.37 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  47.06 
 
 
364 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  50.15 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  46.41 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  45.51 
 
 
349 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  44.88 
 
 
363 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  44.1 
 
 
371 aa  291  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  44.35 
 
 
351 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.43 
 
 
362 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.74 
 
 
348 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.41 
 
 
298 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.14 
 
 
305 aa  285  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  45.04 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.04 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  42.21 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  41.58 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  45.61 
 
 
363 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  45.33 
 
 
363 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.05 
 
 
358 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  45.63 
 
 
363 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  44.76 
 
 
362 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.79 
 
 
362 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.89 
 
 
363 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  45.04 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.38 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  43.63 
 
 
363 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  41.39 
 
 
345 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.65 
 
 
362 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.74 
 
 
357 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  45.94 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  43.43 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
362 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  43.33 
 
 
363 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  42.27 
 
 
364 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.04 
 
 
362 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  42.78 
 
 
365 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  39.48 
 
 
379 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  41.31 
 
 
371 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  41.88 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  50 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  44.26 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.4 
 
 
357 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  42.5 
 
 
362 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  42.5 
 
 
362 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  40.37 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  39.1 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.82 
 
 
363 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  38.89 
 
 
387 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.82 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  41.64 
 
 
362 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.06 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  42.54 
 
 
361 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  44.48 
 
 
363 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  38.89 
 
 
394 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.54 
 
 
363 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  42.45 
 
 
363 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  43.62 
 
 
365 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  40.71 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  49.03 
 
 
360 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  45.09 
 
 
369 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  43.43 
 
 
370 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  44.76 
 
 
361 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  43.43 
 
 
370 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  44.76 
 
 
361 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  43.43 
 
 
370 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  45.09 
 
 
369 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.06 
 
 
363 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  45.09 
 
 
369 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  42.82 
 
 
369 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  49.22 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.97 
 
 
376 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.27 
 
 
371 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  42.9 
 
 
362 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>