More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2357 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 298 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  76.64 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  73.63 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  68.01 
 
 		 395 aa  421  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  66.45 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  71.05 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  67.41 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.38 
 
 		 367 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  50.88 
 
 		 358 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  50.88 
 
 		 358 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  55.2 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  52.77 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  53.41 
 
 		 367 aa  285  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  55.04 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  51.81 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  54.85 
 
 		 360 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  51.76 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  51.76 
 
 		 363 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  53.97 
 
 		 371 aa  278  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  49.44 
 
 		 353 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  49.44 
 
 		 353 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  48.66 
 
 		 368 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  52.12 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  51.15 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  52.4 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  52.9 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  51.55 
 
 		 363 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  55.33 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  51.19 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  56.64 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  48.74 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  51.71 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  50.94 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  47.39 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  50.94 
 
 		 394 aa  270  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  53.31 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  55.36 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  51.35 
 
 		 363 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  51.76 
 
 		 382 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  52.63 
 
 		 374 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  50.94 
 
 		 363 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  43.6 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  53.1 
 
 		 362 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  50.9 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  55.46 
 
 		 375 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  52.9 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  51.36 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  49.28 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  55.04 
 
 		 378 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  51.94 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.81 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  51.71 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  51.61 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.95 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  48.85 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  51.35 
 
 		 362 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.16 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  49.81 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  53.81 
 
 		 358 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.57 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  53.31 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  49.21 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  52.78 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.95 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  51.42 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.95 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  50.59 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  55.29 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  51.55 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  53.48 
 
 		 394 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  55.27 
 
 		 415 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.42 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  52.33 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  54.75 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  52.09 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  50.2 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.55 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.55 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.55 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  48.12 
 
 		 364 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.67 
 
 		 362 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  51.55 
 
 		 363 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  52.97 
 
 		 374 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  51.19 
 
 		 364 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  50.38 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.49 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.49 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  47.49 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  45.98 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  46.77 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.49 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.1 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  54.55 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  49.62 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  45.98 
 
 		 357 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  52.02 
 
 		 389 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  46.99 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  53.19 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  50.43 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.26 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>