More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4935 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 368 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  69.4 
 
 		 367 aa  554  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  69.48 
 
 		 367 aa  518  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  60.44 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  56.27 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  57.1 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  52.07 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  52.33 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.22 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  50 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  52.5 
 
 		 357 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  50.69 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.74 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  48.07 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  49.57 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  49.3 
 
 		 353 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  48.86 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.16 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  50.14 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.54 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  48.92 
 
 		 367 aa  328  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  48.79 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  46.78 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  48.29 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  48.63 
 
 		 356 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  47.41 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.92 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.43 
 
 		 348 aa  296  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  44.84 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  43.94 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  43.77 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.89 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  41.97 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  41.76 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  45.11 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  43.33 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  45.11 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  44.44 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  44.48 
 
 		 357 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  44.83 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.37 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  41.88 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  41.06 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  45.01 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.53 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.28 
 
 		 298 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.02 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.1 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  42.5 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  46.94 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  45.85 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.74 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.74 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  44.09 
 
 		 370 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  44.09 
 
 		 370 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  45.27 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  44.09 
 
 		 370 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  40.05 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  45.56 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  43.47 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  46.23 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  41.48 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.41 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.23 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  42.64 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.21 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  43.53 
 
 		 363 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.62 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  45.65 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  50 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  42.58 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  42.46 
 
 		 362 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  39.43 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  49.62 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  41.27 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1196  putative ATPase  47.52 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  39.62 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  54.36 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  40.49 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  44.76 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  43.23 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  46.23 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  46.23 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  44.48 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  46.54 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  46.23 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  46.23 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  40.17 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>