More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1127 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  100 
 
 
383 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  74.73 
 
 
381 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  75.81 
 
 
378 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  71.24 
 
 
381 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  70.91 
 
 
383 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  72.87 
 
 
381 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  68.17 
 
 
379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  68.97 
 
 
380 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  68.6 
 
 
390 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  69.81 
 
 
390 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  72.36 
 
 
381 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  72.36 
 
 
381 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  72.36 
 
 
381 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  69.07 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  67.9 
 
 
378 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  73.75 
 
 
382 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  68.1 
 
 
384 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  66.94 
 
 
375 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  69.29 
 
 
375 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  68.45 
 
 
380 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  69.29 
 
 
375 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  67.02 
 
 
399 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  74.35 
 
 
411 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  67.82 
 
 
387 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  64.46 
 
 
389 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  66.41 
 
 
384 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  66.22 
 
 
381 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  68.02 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  66.58 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  64.17 
 
 
387 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  64.58 
 
 
381 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  65.5 
 
 
381 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  61.29 
 
 
387 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  63.25 
 
 
387 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  55.01 
 
 
381 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  57.85 
 
 
382 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  52.67 
 
 
377 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  49.3 
 
 
371 aa  331  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  48.47 
 
 
375 aa  324  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  48.19 
 
 
391 aa  285  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  45.43 
 
 
365 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  45.1 
 
 
391 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  40.46 
 
 
347 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  42.3 
 
 
349 aa  269  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  46.2 
 
 
369 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  42.3 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  43.81 
 
 
349 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  43.81 
 
 
349 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  43.81 
 
 
349 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  41.08 
 
 
349 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  43.81 
 
 
349 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  42.94 
 
 
349 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  44.19 
 
 
349 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.95 
 
 
395 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  41.89 
 
 
361 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  41.23 
 
 
356 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  42.7 
 
 
359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  44.12 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  40.11 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  38.29 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  39.73 
 
 
363 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 
353 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  39.15 
 
 
360 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 
353 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  39.78 
 
 
356 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  43.37 
 
 
364 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  40.53 
 
 
368 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  41.19 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  41.24 
 
 
367 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  39.31 
 
 
367 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  41.55 
 
 
367 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
348 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  39.83 
 
 
368 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  39.94 
 
 
356 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  39.34 
 
 
379 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  38.96 
 
 
345 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  35.83 
 
 
370 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  39.3 
 
 
358 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.67 
 
 
305 aa  225  8e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18320  chromosome partitioning ATPase protein  48.83 
 
 
285 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000336344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  37.63 
 
 
351 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  41.69 
 
 
349 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  37.2 
 
 
389 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  39.14 
 
 
356 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  40 
 
 
361 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.89 
 
 
358 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  38.53 
 
 
364 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  38.5 
 
 
358 aa  222  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  40.95 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  40.95 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  40.95 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  40.95 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  38.44 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  38.44 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  36.78 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0179  mrp protein  40.95 
 
 
355 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000468885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0147  mrp protein  40.95 
 
 
355 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0142  hypothetical protein  41.38 
 
 
355 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>