More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
387 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  73.6 
 
 
387 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  71.93 
 
 
374 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  66.93 
 
 
377 aa  484  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  70.08 
 
 
387 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  67.89 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  63.54 
 
 
381 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  64.15 
 
 
383 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  62.8 
 
 
379 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  65.41 
 
 
381 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  62.03 
 
 
375 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  65.15 
 
 
381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  65.15 
 
 
381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  65.15 
 
 
381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  60.57 
 
 
380 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  64.17 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  61.19 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  60.38 
 
 
390 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  61.68 
 
 
384 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  63.07 
 
 
378 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  66.15 
 
 
381 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  61.76 
 
 
381 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  62.57 
 
 
375 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  62.23 
 
 
390 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  61.39 
 
 
380 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  59.21 
 
 
381 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  61.56 
 
 
399 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  61.5 
 
 
375 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  60.59 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  63.73 
 
 
382 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  61.8 
 
 
384 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  64.25 
 
 
381 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  63.47 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  60.43 
 
 
382 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  58.27 
 
 
381 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  58.58 
 
 
387 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  49.6 
 
 
371 aa  334  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  50.67 
 
 
377 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  46.65 
 
 
375 aa  309  5e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  46.81 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  45.48 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  41.99 
 
 
370 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  42.4 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  46.15 
 
 
365 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  42.32 
 
 
349 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  40.33 
 
 
359 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  38.19 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  41.38 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  41.38 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  41.69 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  42.32 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  38.9 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  41.38 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  38.96 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  41.69 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  42.01 
 
 
349 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  41.77 
 
 
349 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  38.95 
 
 
361 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  38.9 
 
 
353 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  39.78 
 
 
367 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  39.78 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  42.34 
 
 
349 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  37.91 
 
 
357 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  35.08 
 
 
347 aa  229  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  38.9 
 
 
356 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  37.26 
 
 
356 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.36 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  37.43 
 
 
395 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  39.62 
 
 
364 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  38.52 
 
 
368 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  36.81 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1569  hypothetical protein  42.98 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  38.24 
 
 
356 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  36.15 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  41.5 
 
 
349 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  42.27 
 
 
361 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  41.79 
 
 
368 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  39.63 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  39.63 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  39.63 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  39.63 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  33.33 
 
 
356 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18320  chromosome partitioning ATPase protein  47.29 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000336344  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  33.52 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  38.93 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.59 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  33.33 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5157  mrp protein  40.38 
 
 
355 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000807541  hitchhiker  0.0000208567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  36.62 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0140  ATP-binding protein; Mrp protein  39.06 
 
 
355 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0147  mrp protein  39.06 
 
 
355 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0179  mrp protein  39.06 
 
 
355 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000468885  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  36.39 
 
 
358 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0169  mrp protein  39.38 
 
 
355 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0723648  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  36.31 
 
 
370 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0142  hypothetical protein  39.38 
 
 
355 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  45.56 
 
 
373 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  34.46 
 
 
365 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>