More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0782 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  100 
 
 		 375 aa  761    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  70.08 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  48.09 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  47.48 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  45.82 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  45.63 
 
 		 379 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  48.79 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  45.58 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  48.47 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  46.7 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  49.44 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  47.2 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  46.61 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  47.03 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  46.24 
 
 		 377 aa  298  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  43.55 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  43.94 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  44.39 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  46.99 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  46.59 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  46.59 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  46.59 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  47.11 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  45.72 
 
 		 384 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  44.92 
 
 		 399 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  44.32 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  46.65 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  45.21 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  46.84 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  46.86 
 
 		 387 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  44.41 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  46.22 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  45.11 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  45.53 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  44.13 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  46.72 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  46.01 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  41.85 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  45.83 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  37.67 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 		 369 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  40.53 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  39.83 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  39.72 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  34.96 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  39.44 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  39.02 
 
 		 367 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  37.6 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  37.6 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  37.6 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  37.07 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  37.33 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  37.37 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  36.8 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  36.8 
 
 		 349 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  36.8 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  38.66 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  36.05 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  36.53 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  36.8 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  31.79 
 
 		 347 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  34.23 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  36.94 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  35.83 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  36.75 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  34.9 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  36.46 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  36.52 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  42.31 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  34.41 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  35.07 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  36.13 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  35.34 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  34.44 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5157  mrp protein  36.56 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000807541  hitchhiker  0.0000208567 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.63 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  43.78 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  35.31 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18320  chromosome partitioning ATPase protein  44.4 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000336344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0142  hypothetical protein  35.87 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0141  ATP-binding protein; Mrp protein  36.89 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000822787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  34.94 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0140  ATP-binding protein; Mrp protein  35.08 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0179  mrp protein  35.08 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000468885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0169  mrp protein  46.98 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0723648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0147  mrp protein  35.08 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  40.24 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  33.24 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  34.88 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  34.88 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  34.88 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  34.88 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.03 
 
 		 305 aa  186  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  34.75 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  34.96 
 
 		 349 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  40 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>