More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1445 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  63.87 
 
 
380 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  63.9 
 
 
390 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  63.05 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  62.08 
 
 
379 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  63.97 
 
 
375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  62.76 
 
 
378 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  62.14 
 
 
399 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  59.21 
 
 
384 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  61.82 
 
 
377 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  63.25 
 
 
383 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  60.05 
 
 
389 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  60.1 
 
 
380 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  59.79 
 
 
381 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  65.25 
 
 
374 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  61.78 
 
 
381 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  61.08 
 
 
387 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  60.05 
 
 
381 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  63.94 
 
 
382 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  59.37 
 
 
381 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  58.91 
 
 
378 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  63.4 
 
 
411 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  60.05 
 
 
384 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  58.84 
 
 
381 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  60.05 
 
 
389 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  58.84 
 
 
381 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  58.84 
 
 
381 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  59.33 
 
 
381 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  58.4 
 
 
375 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  57.67 
 
 
390 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  57.94 
 
 
375 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  60.16 
 
 
381 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  58.58 
 
 
387 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  54.38 
 
 
381 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  56.02 
 
 
387 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  55.44 
 
 
382 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  46.95 
 
 
377 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  48.13 
 
 
371 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  45.83 
 
 
375 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  45.33 
 
 
391 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  46.79 
 
 
365 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  43.32 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  43.99 
 
 
391 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  40.72 
 
 
353 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  37.3 
 
 
370 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  38.67 
 
 
357 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  40.44 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 
353 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  41.6 
 
 
361 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  39.26 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  40.5 
 
 
360 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  40.48 
 
 
356 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  36.64 
 
 
347 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  42.94 
 
 
369 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  44.75 
 
 
361 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  42.93 
 
 
356 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  40.33 
 
 
349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  40.6 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  40.6 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  40.87 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  40.6 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  44.01 
 
 
361 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  40.33 
 
 
349 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  44.01 
 
 
361 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.99 
 
 
395 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  38.48 
 
 
367 aa  232  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  39.63 
 
 
368 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  44.01 
 
 
361 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  40.11 
 
 
356 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  40.33 
 
 
359 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  41.32 
 
 
367 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 
371 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  40.11 
 
 
367 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  39.51 
 
 
349 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  39.78 
 
 
349 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  39.73 
 
 
367 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  39.51 
 
 
349 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  39.47 
 
 
365 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.89 
 
 
367 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  40.85 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  40.97 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.74 
 
 
358 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  39.84 
 
 
358 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  36.91 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  41.51 
 
 
349 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.43 
 
 
358 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  39.09 
 
 
354 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  38.57 
 
 
369 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  37.7 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  38.22 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  36.61 
 
 
364 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  37.63 
 
 
370 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.95 
 
 
348 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.51 
 
 
287 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  37.32 
 
 
366 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  37.81 
 
 
360 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  37.5 
 
 
372 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  36.44 
 
 
382 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.12 
 
 
362 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  38.32 
 
 
374 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>