More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1327 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
376 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  77.87 
 
 
376 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  69.09 
 
 
373 aa  525  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  48.49 
 
 
367 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  50.27 
 
 
367 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
368 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  49.86 
 
 
365 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  50.97 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  48.74 
 
 
368 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.12 
 
 
367 aa  338  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  44.44 
 
 
366 aa  315  7e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.62 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.52 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  44.63 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.31 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  44.03 
 
 
367 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.37 
 
 
357 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  40.5 
 
 
363 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.02 
 
 
361 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
356 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.16 
 
 
395 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  41.54 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  39.39 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  41.87 
 
 
360 aa  265  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  43.52 
 
 
356 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  42.59 
 
 
356 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  39.54 
 
 
358 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  39.89 
 
 
375 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  41.6 
 
 
364 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  39.2 
 
 
356 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  38.87 
 
 
358 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  40 
 
 
363 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.17 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  41.57 
 
 
356 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  50.59 
 
 
305 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  39.94 
 
 
373 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  42.77 
 
 
371 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  39.29 
 
 
378 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  42.61 
 
 
363 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.38 
 
 
345 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  39.6 
 
 
356 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  40.11 
 
 
364 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  39.6 
 
 
357 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.66 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  40.43 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  42.33 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  42.08 
 
 
382 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  39.38 
 
 
357 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  41.32 
 
 
361 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  40.23 
 
 
363 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  41.32 
 
 
367 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  38.87 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  38.97 
 
 
358 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.28 
 
 
358 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.28 
 
 
358 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  41.28 
 
 
349 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.69 
 
 
298 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  41.04 
 
 
371 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  41.48 
 
 
363 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  39.84 
 
 
382 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  40.79 
 
 
362 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.2 
 
 
362 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.28 
 
 
358 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  41.87 
 
 
364 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.4 
 
 
362 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  41.19 
 
 
363 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.57 
 
 
371 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  40.4 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  46.01 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  48 
 
 
391 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  51.29 
 
 
372 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  49.05 
 
 
389 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  43.07 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  40.91 
 
 
363 aa  246  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 
363 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.28 
 
 
358 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  41.9 
 
 
362 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  41.34 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  50.85 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  38.76 
 
 
362 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  38.76 
 
 
362 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.5 
 
 
363 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.5 
 
 
363 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.56 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  49.41 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  46.47 
 
 
384 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.1 
 
 
372 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  48.82 
 
 
387 aa  243  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.9 
 
 
371 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.9 
 
 
371 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.9 
 
 
371 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.2 
 
 
371 aa  242  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.59 
 
 
362 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  47.06 
 
 
374 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  40.54 
 
 
365 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  40 
 
 
363 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  48.32 
 
 
368 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.59 
 
 
351 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>