More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00760 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  756    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  77.87 
 
 
376 aa  615  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  69.44 
 
 
373 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  52.07 
 
 
368 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  51.36 
 
 
367 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.33 
 
 
372 aa  371  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  49.31 
 
 
365 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  49.73 
 
 
367 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  49.58 
 
 
368 aa  352  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  47.91 
 
 
366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.9 
 
 
367 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 
363 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.06 
 
 
357 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  44.35 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  43.25 
 
 
361 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  45.54 
 
 
353 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  45.54 
 
 
353 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.58 
 
 
367 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.86 
 
 
395 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  42.9 
 
 
367 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  43.94 
 
 
356 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.17 
 
 
363 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.37 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.38 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  45.06 
 
 
356 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 
364 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.17 
 
 
358 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  43.16 
 
 
364 aa  269  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  44.58 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  44.44 
 
 
356 aa  265  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  45.4 
 
 
363 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  41.46 
 
 
360 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.23 
 
 
375 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  40.58 
 
 
378 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  43.04 
 
 
361 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  41.76 
 
 
373 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  43.04 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.17 
 
 
358 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.07 
 
 
348 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  40.12 
 
 
358 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  53.33 
 
 
382 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  50.59 
 
 
305 aa  259  8e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  41.72 
 
 
374 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  41.31 
 
 
356 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  43.56 
 
 
363 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  44.85 
 
 
363 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.79 
 
 
363 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  54.24 
 
 
373 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 
363 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  44.85 
 
 
363 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  41.49 
 
 
357 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  42.15 
 
 
349 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  41.98 
 
 
355 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.14 
 
 
358 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.14 
 
 
358 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  53.85 
 
 
384 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  44.17 
 
 
363 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  40.69 
 
 
382 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  41.54 
 
 
371 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  43 
 
 
356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  45.48 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.73 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  51.97 
 
 
374 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  42.77 
 
 
345 aa  252  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  53.22 
 
 
364 aa  252  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  49.8 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  44.61 
 
 
368 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  51.69 
 
 
415 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  50.85 
 
 
372 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  43.25 
 
 
363 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  40.18 
 
 
357 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.29 
 
 
363 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.5 
 
 
298 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  50.61 
 
 
376 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
363 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  40.74 
 
 
358 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  51.27 
 
 
370 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  51.29 
 
 
394 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  42.86 
 
 
362 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.16 
 
 
362 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.11 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  38.1 
 
 
351 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_002978  WD0179  GTP/ATP binding protein, putative  46.21 
 
 
340 aa  248  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  51.84 
 
 
389 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  50.42 
 
 
372 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.11 
 
 
363 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.11 
 
 
363 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.29 
 
 
358 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  52.36 
 
 
361 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.05 
 
 
363 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  43.85 
 
 
362 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  42.5 
 
 
386 aa  246  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.95 
 
 
362 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  52.77 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  41.23 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  49.81 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  52.77 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.66 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  43.04 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>