More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1044 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  100 
 
 
373 aa  749    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  69.09 
 
 
376 aa  541  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  69.44 
 
 
376 aa  539  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  49.31 
 
 
365 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.92 
 
 
372 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  50.41 
 
 
367 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.14 
 
 
367 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  48.07 
 
 
368 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  47.34 
 
 
367 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  47.9 
 
 
368 aa  342  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  45.58 
 
 
366 aa  326  3e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 
363 aa  309  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  41.31 
 
 
361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.41 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 
353 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.68 
 
 
360 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.44 
 
 
357 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 
363 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  43.06 
 
 
374 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.73 
 
 
358 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.98 
 
 
358 aa  276  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.42 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  42.86 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  41.74 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  40.57 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  42.02 
 
 
367 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.52 
 
 
359 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  40.8 
 
 
373 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  40.53 
 
 
378 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  39.44 
 
 
363 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.72 
 
 
305 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  43.09 
 
 
374 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  40.73 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  42.36 
 
 
364 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  49.81 
 
 
358 aa  268  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.64 
 
 
351 aa  267  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  41.81 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  42.66 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  40.79 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  42.94 
 
 
364 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  42.66 
 
 
363 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  41.55 
 
 
356 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.1 
 
 
345 aa  265  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  41.85 
 
 
361 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  40.58 
 
 
384 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.19 
 
 
382 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  42.24 
 
 
356 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_002978  WD0179  GTP/ATP binding protein, putative  42.98 
 
 
340 aa  263  4e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  40.58 
 
 
382 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  43.45 
 
 
368 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  40.44 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.24 
 
 
357 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.38 
 
 
298 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  41.27 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.83 
 
 
358 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  40.06 
 
 
355 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.83 
 
 
358 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  41.84 
 
 
356 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.22 
 
 
362 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.3 
 
 
354 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  41.27 
 
 
363 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.68 
 
 
348 aa  260  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  41 
 
 
363 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  40.58 
 
 
358 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  41.93 
 
 
357 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  42.11 
 
 
363 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  48.75 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  50.58 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  40.96 
 
 
357 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  40.91 
 
 
356 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  40.66 
 
 
386 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  39.11 
 
 
363 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  50.19 
 
 
394 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  40.22 
 
 
357 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  41.11 
 
 
365 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.46 
 
 
358 aa  256  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  50.19 
 
 
415 aa  255  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  43.37 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  38.17 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.39 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.55 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  39.77 
 
 
364 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  42.33 
 
 
382 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  42.15 
 
 
349 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  38.84 
 
 
362 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  47.51 
 
 
379 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.55 
 
 
363 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  48.62 
 
 
372 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  40.44 
 
 
363 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
354 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.89 
 
 
363 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  40.12 
 
 
336 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.61 
 
 
363 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  39.23 
 
 
373 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42 
 
 
370 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>