More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0508 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  100 
 
 
390 aa  785    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  81.27 
 
 
379 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  76.18 
 
 
383 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  73.14 
 
 
380 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  72.07 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  69.11 
 
 
381 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  68.85 
 
 
381 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  68.6 
 
 
383 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  66.93 
 
 
384 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  66.13 
 
 
399 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  65.78 
 
 
380 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  63.81 
 
 
375 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  66.67 
 
 
377 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  65.6 
 
 
381 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  67.3 
 
 
390 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  67.02 
 
 
381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  67.02 
 
 
381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  67.02 
 
 
381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  65.78 
 
 
378 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  65.88 
 
 
375 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  62.43 
 
 
389 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  65.35 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  63.8 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  63.1 
 
 
381 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  65.68 
 
 
374 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  64.95 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  67.47 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  63.9 
 
 
387 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  65.97 
 
 
411 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  64.63 
 
 
381 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  62.89 
 
 
381 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  63.66 
 
 
384 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  60.31 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  60.38 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  57.68 
 
 
381 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  58.79 
 
 
382 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  48.91 
 
 
377 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  48.75 
 
 
371 aa  324  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  48.09 
 
 
375 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  50.14 
 
 
391 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  48.43 
 
 
391 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  47.69 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  39.66 
 
 
347 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  41.83 
 
 
349 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  41.83 
 
 
349 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  41.55 
 
 
349 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  41.55 
 
 
349 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  41.27 
 
 
349 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  41.27 
 
 
349 aa  272  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  41.27 
 
 
349 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  45.86 
 
 
370 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  41.23 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  41.5 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  41.85 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  41.85 
 
 
353 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  42.94 
 
 
369 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  40.11 
 
 
356 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  40.06 
 
 
353 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  40.5 
 
 
361 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  43.41 
 
 
364 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  40.27 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  39.66 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  40.27 
 
 
367 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  38.59 
 
 
370 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  41.03 
 
 
367 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.61 
 
 
395 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  37.4 
 
 
363 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  40.5 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  35.67 
 
 
357 aa  245  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  37.57 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  38.25 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18320  chromosome partitioning ATPase protein  50.81 
 
 
285 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000336344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.48 
 
 
358 aa  239  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0142  hypothetical protein  40.39 
 
 
355 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  37.81 
 
 
358 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  40.16 
 
 
349 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  40.22 
 
 
356 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  39.94 
 
 
367 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.22 
 
 
367 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  40.64 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  40.52 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  40.64 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  39.95 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0141  ATP-binding protein; Mrp protein  39 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000822787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5157  mrp protein  42.24 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000807541  hitchhiker  0.0000208567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  39.78 
 
 
354 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  39.78 
 
 
354 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  39.78 
 
 
354 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  39.78 
 
 
354 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0140  ATP-binding protein; Mrp protein  39.55 
 
 
355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  38.4 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0147  mrp protein  39.55 
 
 
355 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0179  mrp protein  39.55 
 
 
355 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000468885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  39.89 
 
 
384 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0169  mrp protein  41.93 
 
 
355 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0723648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  38.61 
 
 
368 aa  229  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  37.71 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  38.55 
 
 
354 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.55 
 
 
354 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  40.11 
 
 
368 aa  225  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>