284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0809 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0809  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1180  hypothetical protein  76.36 
 
 
56 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  43 
 
 
315 aa  88.6  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  40.57 
 
 
323 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  42.35 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  34.48 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.04 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  42.5 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  50.88 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  39.29 
 
 
320 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  39.78 
 
 
105 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  41.98 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  43.37 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  39.02 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  35.48 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  39.76 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  38.04 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  39.76 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.24 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  41.46 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  43.75 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
117 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  36.67 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  57.69 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  41.03 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  40.51 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  36.67 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  39.02 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  40.96 
 
 
115 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  38.46 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40.51 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  43.02 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  42.5 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  52.73 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  36.14 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  41.56 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  42.22 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  42.31 
 
 
391 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  33.71 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  45.31 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  45.35 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  45.35 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  39.53 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  39.24 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  39.24 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  38.27 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  40.26 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1569  hypothetical protein  43.21 
 
 
349 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118472  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  42.5 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  37.21 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  36.84 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  43.04 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  35.8 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  31.58 
 
 
314 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  37.97 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  37.08 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  38.27 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  38.27 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  38.27 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.02 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  44.19 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  32.91 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  39.56 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  47.06 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  37.35 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  34.83 
 
 
108 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  46.55 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  44.87 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  34.83 
 
 
108 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  48.28 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  35.16 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  43.21 
 
 
387 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  34.21 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  39.02 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  33.71 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  40.26 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.94 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  47.37 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  38.96 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40.45 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  33.33 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  37.65 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  34.21 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  38.96 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>