More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1353 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 504 aa  1018    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  45.2 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  39.96 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  39.03 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 508 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  35.74 
 
 		 508 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  35.54 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  35.74 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  35.34 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.54 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.54 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 507 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.54 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 508 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.94 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.74 
 
 		 508 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 		 604 aa  335  9e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 592 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.47 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.27 
 
 		 525 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.87 
 
 		 479 aa  316  8e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 508 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 506 aa  263  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  35.92 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 531 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  38.16 
 
 		 517 aa  256  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 501 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 502 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  34.02 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.33 
 
 		 507 aa  223  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 507 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.02 
 
 		 227 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 388 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  25.31 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 429 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 425 aa  100  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 429 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 425 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 429 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 429 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  28.95 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  24.94 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  27.75 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.42 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 431 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 429 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 494 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 424 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  28.53 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  27.96 
 
 		 438 aa  86.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25.91 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>