More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1938 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  86.71 
 
 
429 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  95.34 
 
 
429 aa  836    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  72.49 
 
 
429 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  87.88 
 
 
429 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  96.74 
 
 
429 aa  866    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  97.44 
 
 
429 aa  851    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
429 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  78.12 
 
 
429 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  74.59 
 
 
429 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  97.2 
 
 
429 aa  853    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  87.18 
 
 
429 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  87.41 
 
 
429 aa  797    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  72.49 
 
 
429 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  71.1 
 
 
429 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  63.87 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  63.47 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  63.32 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 
435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 
435 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  62.15 
 
 
435 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 
427 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  62.76 
 
 
452 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  63 
 
 
436 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
435 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 
437 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  43.19 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 
435 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
437 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 
431 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.93 
 
 
439 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  43.26 
 
 
435 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 
431 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  42.72 
 
 
431 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  43.46 
 
 
439 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  43.6 
 
 
438 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  42.32 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
435 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
435 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
434 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
435 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.14 
 
 
427 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.14 
 
 
427 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
440 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 
436 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
427 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 
428 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
427 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  39.05 
 
 
428 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
428 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
428 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
427 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
428 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 
436 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
433 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  40.1 
 
 
427 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.34 
 
 
430 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 
428 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
427 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
428 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  37.38 
 
 
427 aa  317  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  39.9 
 
 
430 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
430 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  37.14 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
433 aa  312  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 
430 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 
426 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 
427 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.47 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
437 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
423 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 
435 aa  299  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  39.34 
 
 
430 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
425 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  39.34 
 
 
430 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
429 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  39.1 
 
 
430 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  37.44 
 
 
449 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  42.62 
 
 
430 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 
430 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>