265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0624 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 503 aa  1014    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  58.25 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  53.2 
 
 		 517 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  45.03 
 
 		 518 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 510 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 513 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 521 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 524 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 508 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 592 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  29.94 
 
 		 508 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  29.94 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  29.94 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 516 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.52 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.52 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  29.73 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  29.52 
 
 		 508 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  31 
 
 		 521 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.31 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.73 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 508 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.63 
 
 		 479 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 508 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 504 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.87 
 
 		 525 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.11 
 
 		 504 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.66 
 
 		 525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  26.08 
 
 		 507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.63 
 
 		 227 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  30.85 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  48.05 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.56 
 
 		 139 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  25.45 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  26.63 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  28.35 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.47 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.22 
 
 		 139 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.56 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  53.33 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  55.56 
 
 		 180 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  54.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.33 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.36 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  39.74 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.88 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  48.89 
 
 		 179 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  26.45 
 
 		 430 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  53.33 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  51.11 
 
 		 180 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.36 
 
 		 181 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  51.11 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  26.52 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  25.31 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  22.19 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  53.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>