More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3526 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  880    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  65.34 
 
 
427 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  63.12 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 
428 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  61.45 
 
 
428 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  60.66 
 
 
427 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 
428 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  61.92 
 
 
428 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  61.92 
 
 
428 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  60.05 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  60.98 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  59.95 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 
428 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  59.35 
 
 
428 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  60.05 
 
 
428 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  60.05 
 
 
428 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  58.31 
 
 
427 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 
427 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 
427 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 
427 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  60.98 
 
 
428 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
427 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  57.61 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 
427 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  56.67 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  54.37 
 
 
426 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  54.61 
 
 
426 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 
426 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 
427 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 
436 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.26 
 
 
439 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  42.53 
 
 
439 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  42.06 
 
 
430 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.62 
 
 
437 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  42.55 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 
436 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 
437 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 
437 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  41 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
433 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
433 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  41.08 
 
 
430 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  41.08 
 
 
430 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 
430 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
433 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
433 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  41.08 
 
 
430 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  41.41 
 
 
431 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
423 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
429 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
429 aa  318  9e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.03 
 
 
435 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
441 aa  316  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
433 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 
429 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  38.34 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  39.9 
 
 
433 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 
433 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 
429 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 
433 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  39.15 
 
 
427 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
435 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 
435 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
429 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  40.39 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>