More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0409 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 504 aa  1026    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  98.62 
 
 		 507 aa  987    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  64.23 
 
 		 502 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 504 aa  1026    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 		 518 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  51.1 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  47.53 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 513 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 524 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.2 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  33.26 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.41 
 
 		 508 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  33.27 
 
 		 508 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.99 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.6 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  33.6 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 604 aa  243  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.59 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.59 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 521 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 507 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.02 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  28.96 
 
 		 521 aa  217  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 504 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 506 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 482 aa  206  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.91 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.69 
 
 		 525 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 508 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 531 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 435 aa  171  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  30.04 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  30.69 
 
 		 394 aa  163  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  26.95 
 
 		 507 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 388 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 		 227 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  26.96 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  25.9 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  24.87 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  25.38 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.43 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.51 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  26.1 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.94 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  23.38 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  23.43 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  20 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  25 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>