More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0616 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 411 aa  801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  97.08 
 
 		 440 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  88.81 
 
 		 406 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  72.29 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  66.17 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  65.74 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  48.64 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  44.69 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  41.55 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  43.92 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  46.33 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  42.71 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  39.95 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  41.49 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  39.01 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  41.02 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  40.5 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  46.54 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  41.09 
 
 		 376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  33.7 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  38.34 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  40.32 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  41.31 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  35.42 
 
 		 652 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  34.84 
 
 		 1033 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  38.38 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.89 
 
 		 666 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  32.02 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  31.93 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.18 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  41.09 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.18 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.18 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  40.37 
 
 		 384 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  39.68 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 666 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  36.71 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  40.52 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.39 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  30.9 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  30.9 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  30.62 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  38.69 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  33.87 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  35.17 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  40.06 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.36 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  33.97 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  28.57 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  38.89 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.06 
 
 		 652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  33.25 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  32.16 
 
 		 367 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  31.11 
 
 		 684 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.67 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.22 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.12 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  30.83 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  32.44 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  34.52 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.49 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  32.68 
 
 		 363 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.14 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  32.18 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.84 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  32.23 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  34.66 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.29 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32.97 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.33 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.27 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  32.17 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  35.99 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.01 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  34.39 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  33.07 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.27 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  39.23 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  31.99 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  31.99 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  31.99 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>