More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0139 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
376 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  98.14 
 
 
376 aa  709    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  97.87 
 
 
376 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  83.65 
 
 
375 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  45.05 
 
 
371 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  42.2 
 
 
382 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  43.05 
 
 
405 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  41.48 
 
 
374 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  44.27 
 
 
392 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  42.74 
 
 
373 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  40 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  41 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  40.83 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  41.02 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  36.83 
 
 
652 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  43.18 
 
 
401 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  36.73 
 
 
368 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  37.57 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 
393 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.66 
 
 
367 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 
404 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  38.76 
 
 
375 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  37.47 
 
 
372 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  36.56 
 
 
378 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 
365 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  41.24 
 
 
410 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  41.46 
 
 
368 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  34.12 
 
 
1033 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.89 
 
 
391 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  41.6 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.73 
 
 
666 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  39.94 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 
666 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  34.5 
 
 
367 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
376 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  34.04 
 
 
363 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
363 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.34 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.34 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  39.74 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  36.68 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  41.04 
 
 
406 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
369 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  30.77 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  35.36 
 
 
361 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
360 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 
369 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.71 
 
 
367 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
369 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  35.95 
 
 
361 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  31.05 
 
 
369 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  34.32 
 
 
368 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  34.08 
 
 
652 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
369 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
369 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
365 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  30.77 
 
 
369 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
367 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  32.56 
 
 
367 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
366 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
365 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  32.82 
 
 
684 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.47 
 
 
372 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 
365 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  30.2 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.91 
 
 
386 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.8 
 
 
398 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
380 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
365 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.99 
 
 
367 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
378 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.5 
 
 
371 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  33.24 
 
 
371 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.96 
 
 
355 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  37 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  37.53 
 
 
375 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  38.52 
 
 
395 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  33.52 
 
 
364 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.02 
 
 
417 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.78 
 
 
417 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  33.05 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  34.83 
 
 
349 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
393 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.2 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  35.19 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  40.55 
 
 
389 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  29.6 
 
 
371 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  29.49 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  29.49 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.19 
 
 
371 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.33 
 
 
371 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  29.33 
 
 
371 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  29.33 
 
 
371 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  36.47 
 
 
342 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
360 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>