More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5036 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 360 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  55.92 
 
 		 652 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  57.35 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  56.79 
 
 		 666 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  56.51 
 
 		 666 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  51.32 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  50.64 
 
 		 684 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  43.55 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  40.17 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  43.55 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  36.36 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.9 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  38.31 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  36.08 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.9 
 
 		 367 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  42.46 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  37.11 
 
 		 367 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  37.11 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  35.01 
 
 		 1033 aa  199  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  36.1 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  37.13 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  39.43 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  36.14 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  31.32 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  32.05 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.32 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.32 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.04 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  31.87 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.04 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.04 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  35.43 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  31.59 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.25 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  34.75 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  34.22 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.06 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  36.36 
 
 		 392 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.5 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  38.67 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  34.28 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.42 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  34.18 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.97 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.15 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  33.79 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  34.95 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.85 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  36.59 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  31.55 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  33.76 
 
 		 402 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  37.23 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.92 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  34.72 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  32.23 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  34.55 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.43 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.4 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.62 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  34.97 
 
 		 368 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  32.84 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  32.84 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  32.79 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.84 
 
 		 375 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  34.79 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.62 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  31.64 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  34.95 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  35.21 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  48.03 
 
 		 149 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.08 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.92 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.06 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.54 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>