More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1426 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
374 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  71.58 
 
 
375 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  70.24 
 
 
373 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  70.08 
 
 
371 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  70.08 
 
 
371 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  69.81 
 
 
371 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  69.54 
 
 
371 aa  534  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  69.81 
 
 
371 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  69.81 
 
 
371 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  69.27 
 
 
371 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  69.27 
 
 
371 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  69.27 
 
 
371 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  69.54 
 
 
371 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 
371 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  44.85 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
377 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  37.17 
 
 
367 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  37.23 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
375 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.86 
 
 
370 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 
372 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.83 
 
 
367 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.94 
 
 
364 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.21 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
367 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 
382 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
366 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.44 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 
367 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.65 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
365 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.87 
 
 
363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
361 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 
405 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  27.52 
 
 
365 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 
361 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 
374 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
375 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
376 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
365 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
365 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.53 
 
 
652 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.51 
 
 
392 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.18 
 
 
368 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
366 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.99 
 
 
376 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
378 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  32.94 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.84 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.17 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.34 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  29.17 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.88 
 
 
411 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  26.44 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  30.28 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.32 
 
 
369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.32 
 
 
369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  33.18 
 
 
1033 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
379 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.04 
 
 
369 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.97 
 
 
369 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.77 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.04 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  27.12 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.44 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.69 
 
 
369 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  22.98 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.4 
 
 
369 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.77 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.77 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29.63 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.43 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.19 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.95 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.58 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.92 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  25.07 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  25.63 
 
 
666 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.35 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.28 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>