More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3051 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 366 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  87.74 
 
 		 367 aa  634    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  27.78 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  27.94 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  27.49 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  27.49 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  27.49 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.49 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.49 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  27.06 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  27.06 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.12 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.38 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.22 
 
 		 411 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.3 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.95 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.81 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.23 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  38.04 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.28 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  29.38 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.95 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.08 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  28.57 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.56 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  33.82 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  36.41 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  30.1 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.75 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.46 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.91 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.92 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.7 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.7 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.82 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.82 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.19 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.48 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.82 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  29.05 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.48 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.1 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  35.96 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  24.57 
 
 		 666 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.47 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.51 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.2 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.07 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.14 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  30.69 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.48 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.9 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.18 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.06 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.78 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.11 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  21.58 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.26 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>